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科研人員繪制出陸地棉和海島棉的參考基因組

2018-12-05 03:00:01  新華網(wǎng)    參與評論()人

原標(biāo)題:科研人員繪制出陸地棉和海島棉的參考基因組

新華社武漢12月4日電(記者李偉,、俞儉)解碼棉花基因組能深入了解棉花種的起源進(jìn)化及棉花重要農(nóng)藝性狀形成的遺傳基礎(chǔ),,華中農(nóng)業(yè)大學(xué)棉花遺傳改良團(tuán)隊(duì)聯(lián)合海外研究團(tuán)隊(duì),,共同解析了異源四倍體栽培種陸地棉和海島棉的參考基因組序列,為棉花基因組進(jìn)化和功能基因研究提供了重要參考,。國際權(quán)威期刊《自然-遺傳學(xué)》3日在線發(fā)表了這一最新研究成果,。

陸地棉和海島棉是當(dāng)前棉花生產(chǎn)上主要使用的兩個(gè)異源四倍體栽培種,陸地棉產(chǎn)量高,,適應(yīng)性強(qiáng),,海島棉的產(chǎn)量低,但是其纖維品質(zhì)比陸地棉優(yōu),。雖然兩個(gè)棉花的基因組草圖已經(jīng)發(fā)表,但是由于組裝質(zhì)量和完整性不高,,究竟哪些基因組片段控制海島棉優(yōu)異纖維品質(zhì)的形成等一直不清楚,。

為了得到精細(xì)的基因組序列,這項(xiàng)研究利用第三代測序技術(shù),、光學(xué)圖譜技術(shù)和染色質(zhì)高級結(jié)構(gòu)捕獲技術(shù)進(jìn)行聯(lián)合組裝。與此前最新發(fā)表的基因組草圖相比,,這項(xiàng)研究組裝的基因組序列,,在連續(xù)性和完整性上有極大提高,,陸地棉基因組,、海島棉基因組的連續(xù)性分別提高了55倍,、90倍,。

華農(nóng)棉花遺傳改良團(tuán)隊(duì)負(fù)責(zé)人張獻(xiàn)龍教授介紹,,這項(xiàng)研究成功組裝了高度重復(fù)的基因組區(qū)域,,通過比較兩個(gè)棉花四倍體種的基因組,,發(fā)現(xiàn)二者存在大量的結(jié)構(gòu)變異,。兩個(gè)異源四倍體栽培種各有26對染色體,研究發(fā)現(xiàn),,兩個(gè)棉花種的14條染色體之間存在染色體臂內(nèi)和臂間的大片段倒位現(xiàn)象,,也就是說“兩個(gè)棉花種之間基因組差異很大”。

為了基于棉花基因組的纖維遺傳改良研究,,科研人員還對陸地棉和海島棉之間的遺傳導(dǎo)入系材料進(jìn)行基因組分析,,鑒定了13個(gè)控制纖維品質(zhì)的遺傳位點(diǎn),探究了遺傳位點(diǎn)的表達(dá)調(diào)控機(jī)制,。這項(xiàng)研究為今后通過海島棉改良陸地棉的種間漸滲育種提供了參考,。


(責(zé)任編輯:路子康 CN078)
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