1985年12月,,王小謨被任命為38所所長,。1988年底,,38所調(diào)整遷建終于正式啟動(dòng),,38所整體遷建安徽合肥,。
在調(diào)整遷建過程中,,王小謨率領(lǐng)38所干部職工一方面穩(wěn)妥完成了千頭萬緒的遷建任務(wù),,另一方面又全力保證科研生產(chǎn)不受影響,。按照王小謨發(fā)展出口裝備創(chuàng)匯的思路,,38所自主研制生產(chǎn)了JY-9、384等先進(jìn)雷達(dá),,成功開拓了國際市場,,不僅解決了38所遷建合肥資金匱乏的問題,完成了38所的“二次創(chuàng)業(yè)”,,更創(chuàng)造了中國雷達(dá)出口的新奇跡,。1995年,JY-9雷達(dá)榮獲國家科學(xué)技術(shù)進(jìn)步一等獎(jiǎng),。
1992年2月,,王小謨被任命為中國電子工業(yè)總公司軍工局局長,時(shí)年54歲的王小謨由此開啟了預(yù)警機(jī)裝備的論證與研制之路,,推動(dòng)實(shí)現(xiàn)了我國國土防空網(wǎng)從地面向空中的飛躍,,更是推動(dòng)實(shí)現(xiàn)了我國從國土防空向攻防兼?zhèn)涞闹卮筠D(zhuǎn)型。
1992年,,我國正式啟動(dòng)與國外先進(jìn)國家的合作研制,;1993年6月,王小謨調(diào)任電子科學(xué)研究院常務(wù)副院長,,并出任中方負(fù)責(zé)人,。研制過程中,王小謨創(chuàng)造性提出背負(fù)式,、大圓盤,、三面有源相控陣?yán)走_(dá)的新型預(yù)警機(jī)方案,同時(shí)力排眾議,堅(jiān)持同步安排國內(nèi)配套研制,,使得我國在較短時(shí)間內(nèi)掌握了相控陣?yán)走_(dá)收發(fā)組件,、大型天線罩和系統(tǒng)軟件等重大關(guān)鍵技術(shù),從而將預(yù)警機(jī)發(fā)展的主動(dòng)權(quán)掌握在自己手里,。
2000年7月,,在西方大國的阻撓和施壓下,外方選擇單方面撕毀合作合同,,我國預(yù)警機(jī)裝備發(fā)展面臨何去何從的關(guān)鍵時(shí)刻,。王小謨堅(jiān)持自主研制,大力推動(dòng)國內(nèi)立項(xiàng),。時(shí)任國家主席江澤民同志作出重要批示:“研制部門一定要爭口氣,,否則總是要被人卡脖子!”造出中國人自己的“爭氣機(jī)”,,就是以王小謨?yōu)榇淼膹V大科研人員為之舍命奮斗,、協(xié)同攻關(guān)的事業(yè)和信念。