考慮到石經(jīng)山開放后游客的不斷踩踏有可能對千年古道產(chǎn)生影響,，千年古道的整體保護與棧道鋪設工程也納入大遺址保護工程中,。上寺和曝經(jīng)臺遺址保護展示與周邊環(huán)境整治工程也同期進行,。

房山石經(jīng)與云居寺文化研究中心主任羅炤表示，目前當務之急是開展石經(jīng)山洞內(nèi)文物保護狀況的調(diào)查,，對藏經(jīng)洞內(nèi)部進行系統(tǒng)監(jiān)測工作，著眼于保護和病害治理等,。雖然藏經(jīng)洞都是密封的,，但目前雨水滲入洞穴，對石經(jīng)產(chǎn)生巨大威脅,。

“石頭不怕干,，也不怕泡在水里，就怕一干一濕,?！绷_炤透露，現(xiàn)在有一種保護思路是將石經(jīng)轉(zhuǎn)移到山下,，建立石經(jīng)博物館,。這樣對保護石經(jīng)有利，但藏經(jīng)洞遺址肯定會被改變,。而在原址保護,，對石經(jīng)的保存又是難題。究竟何去何從,，還要經(jīng)過專家集體論證,，最終確定保護方案上報國家文物局。

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石經(jīng)山與雷音洞

石經(jīng)山海拔450米,，有“小西天”之稱,，與云居寺共同構(gòu)成了云居寺文化景觀群,。這里是房山石經(jīng)刊刻起源之地，是佛祖舍利出土之處,。而石經(jīng)山的價值遠不止石經(jīng),，還有以雷音洞、金仙公主塔,、隋唐的千年古道,、古井等為代表的眾多歷史遺跡，具有極高的歷史文化價值,。

石經(jīng)山山腰分兩層,，共有九個藏經(jīng)洞，洞內(nèi)存放自隋至明朝的刻經(jīng)石板,，其中雷音洞是目前唯一開放的藏經(jīng)洞,，洞內(nèi)寬廣如殿，四壁鑲嵌經(jīng)版都是靜琬大師早期所刻,。洞中有四根石柱,，石柱上雕刻佛像1056尊，故稱千佛柱,。雷音洞也是我國最早的人工構(gòu)筑石質(zhì)佛殿,。