條例建立了自然岸線保有率管控制度。規(guī)定由福建省政府確定沿海各設(shè)區(qū)的市自然岸線保有率目標(biāo)任務(wù),，并納入政府績效考核體系,，確保福建省自然岸線保有率高于國家下達(dá)福建省到2020年大陸自然岸線保有率不得低于37%的要求；福建省政府和沿海各市,、縣,、區(qū)政府每年開展一次自然岸線保有率統(tǒng)計，并向社會公布統(tǒng)計結(jié)果；沿海設(shè)區(qū)的市政府海洋與漁業(yè)行政主管部門負(fù)責(zé)劃定自然岸線保護(hù)范圍,，經(jīng)同級政府批準(zhǔn)后向社會公布,。

條例在全國率先建立了由海洋與漁業(yè)行政主管部門牽頭的海岸帶綜合管理體制。明確規(guī)定由各級海洋與漁業(yè)行政主管部門負(fù)責(zé)牽頭綜合協(xié)調(diào)和解決本轄區(qū)海岸帶保護(hù)與利用工作中的重大問題,，發(fā)改,、住建、國土,、環(huán)保,、林業(yè)等部門按照條例規(guī)定分別負(fù)責(zé)相應(yīng)管理職責(zé)，財政,、科技,、交通運輸、水利,、旅游,、海事、文物管理和其他有關(guān)部門各司其職,、密切配合,。

條例建立了由各級政府主導(dǎo)的海岸帶監(jiān)督管理執(zhí)法聯(lián)合聯(lián)動機制。要求福建省和沿海各市,、縣,、區(qū)政府要建立海岸帶監(jiān)督管理執(zhí)法聯(lián)合聯(lián)動機制，組織有關(guān)部門制定本轄區(qū)海岸帶監(jiān)督管理年度計劃,，按照計劃組織開展工作,，組織有關(guān)部門加強海岸帶巡查。條例要求沿海鄉(xiāng)鎮(zhèn)人民政府,、街道辦事處要加強海岸帶基層管理隊伍建設(shè),，做好海岸帶保護(hù)與利用管理相關(guān)工作，并指導(dǎo)村（居）民委員會配合做好海岸帶管理工作,。各級海洋與漁業(yè)行政主管部門要會同國土,、環(huán)保等部門加強對公共沙灘使用的監(jiān)督管理。

此外,，條例還對公共沙灘的保護(hù)和管理,、強化對圍海填海的管控、鼓勵海岸帶整治修復(fù)以及陸源污染物排海和漁業(yè)養(yǎng)殖管理等內(nèi)容做了詳細(xì)規(guī)定,。