條例建立了自然岸線保有率管控制度,。規(guī)定由福建省政府確定沿海各設區(qū)的市自然岸線保有率目標任務,，并納入政府績效考核體系,，確保福建省自然岸線保有率高于國家下達福建省到2020年大陸自然岸線保有率不得低于37%的要求；福建省政府和沿海各市,、縣,、區(qū)政府每年開展一次自然岸線保有率統(tǒng)計，并向社會公布統(tǒng)計結果,；沿海設區(qū)的市政府海洋與漁業(yè)行政主管部門負責劃定自然岸線保護范圍,，經同級政府批準后向社會公布。

條例在全國率先建立了由海洋與漁業(yè)行政主管部門牽頭的海岸帶綜合管理體制,。明確規(guī)定由各級海洋與漁業(yè)行政主管部門負責牽頭綜合協(xié)調和解決本轄區(qū)海岸帶保護與利用工作中的重大問題,，發(fā)改、住建,、國土,、環(huán)保、林業(yè)等部門按照條例規(guī)定分別負責相應管理職責,，財政,、科技、交通運輸,、水利,、旅游、海事,、文物管理和其他有關部門各司其職,、密切配合。

條例建立了由各級政府主導的海岸帶監(jiān)督管理執(zhí)法聯(lián)合聯(lián)動機制,。要求福建省和沿海各市,、縣、區(qū)政府要建立海岸帶監(jiān)督管理執(zhí)法聯(lián)合聯(lián)動機制,，組織有關部門制定本轄區(qū)海岸帶監(jiān)督管理年度計劃,，按照計劃組織開展工作，組織有關部門加強海岸帶巡查,。條例要求沿海鄉(xiāng)鎮(zhèn)人民政府,、街道辦事處要加強海岸帶基層管理隊伍建設，做好海岸帶保護與利用管理相關工作,，并指導村（居）民委員會配合做好海岸帶管理工作,。各級海洋與漁業(yè)行政主管部門要會同國土、環(huán)保等部門加強對公共沙灘使用的監(jiān)督管理,。

此外,，條例還對公共沙灘的保護和管理、強化對圍海填海的管控、鼓勵海岸帶整治修復以及陸源污染物排海和漁業(yè)養(yǎng)殖管理等內容做了詳細規(guī)定,。