菊屬植物是一個(gè)非常大的種類,包括菊組和苞葉組兩大分支,,在每一個(gè)品種之下又有數(shù)量不等的栽培種,具有很高的觀賞價(jià)值和藥用價(jià)值,。此次完成菊屬植物全基因組測序,,將有助于培育更具觀賞價(jià)值,更具藥用價(jià)值的菊屬植物,。
菊屬植物基因組復(fù)雜,,值得深入開發(fā)
面對菊花的復(fù)雜染色體遺傳結(jié)構(gòu)以及豐富的種質(zhì)資源多樣性,進(jìn)行菊花基因組測序?qū)τ诮沂揪諏傥锓N的起源進(jìn)化及物種多樣性具有重要意義,。對此,,2016年,中國中醫(yī)科學(xué)院中藥研究所和安利植物研發(fā)中心共同開啟科研攻關(guān),,最終利用納米孔測序技術(shù)突破復(fù)雜基因組測序,,在菊屬植物研究中邁出了人類認(rèn)知的重要一步?! ?/p>
該科研團(tuán)隊(duì)相關(guān)負(fù)責(zé)人介紹說,,利用納米孔測序結(jié)合二代高通量測序技術(shù)對分布于江蘇南京的野菊花品種進(jìn)行的全基因測序、組裝,、注釋及相關(guān)分析,共組裝出了約3Gb基因組總長,,鑒定出了101745個(gè)編碼蛋白基因,通過比較研究發(fā)現(xiàn),整個(gè)基因組中存在大量的重復(fù)序列,,這可能是整個(gè)菊屬植物基因組較為復(fù)雜的原因,,同時(shí)對多倍體菊花品種杭白菊進(jìn)行起了全長轉(zhuǎn)錄組比較分析,闡明野菊花和杭白菊直接存在極大的遺傳上的親緣關(guān)系,?! ?/p>
“菊花基因組測序的完成,不僅對菊屬的物種多樣性研究,、菊花的遺傳進(jìn)化機(jī)制研究和分子遺傳育種等研究工作具有重要的意義,,而且對研究具有重要藥用價(jià)值的多倍體藥用菊花——杭白菊具有重大的參考價(jià)值?!痹撠?fù)責(zé)人表示,,他們在全球率先使用納米孔測序這一最新的測序技術(shù),完成了高等植物中全基因組測序,,并克服了之前在二代測序技術(shù)時(shí)代解決不了的高雜合,、高重復(fù)基因組組裝的難題,此舉必將極大推動(dòng)植物基因組,、尤其是藥用植物基因組研究的發(fā)展,是本草基因組學(xué)研究的一項(xiàng)重要突破,。