菊屬植物是一個非常大的種類,,包括菊組和苞葉組兩大分支,,在每一個品種之下又有數(shù)量不等的栽培種,具有很高的觀賞價值和藥用價值,。此次完成菊屬植物全基因組測序,將有助于培育更具觀賞價值,,更具藥用價值的菊屬植物,。
菊屬植物基因組復(fù)雜,值得深入開發(fā)
面對菊花的復(fù)雜染色體遺傳結(jié)構(gòu)以及豐富的種質(zhì)資源多樣性,,進行菊花基因組測序?qū)τ诮沂揪諏傥锓N的起源進化及物種多樣性具有重要意義,。對此,2016年,,中國中醫(yī)科學(xué)院中藥研究所和安利植物研發(fā)中心共同開啟科研攻關(guān),,最終利用納米孔測序技術(shù)突破復(fù)雜基因組測序,在菊屬植物研究中邁出了人類認知的重要一步,?! ?/p>
該科研團隊相關(guān)負責(zé)人介紹說,利用納米孔測序結(jié)合二代高通量測序技術(shù)對分布于江蘇南京的野菊花品種進行的全基因測序,、組裝,、注釋及相關(guān)分析,共組裝出了約3Gb基因組總長,鑒定出了101745個編碼蛋白基因,通過比較研究發(fā)現(xiàn),,整個基因組中存在大量的重復(fù)序列,,這可能是整個菊屬植物基因組較為復(fù)雜的原因,同時對多倍體菊花品種杭白菊進行起了全長轉(zhuǎn)錄組比較分析,,闡明野菊花和杭白菊直接存在極大的遺傳上的親緣關(guān)系,。
“菊花基因組測序的完成,,不僅對菊屬的物種多樣性研究,、菊花的遺傳進化機制研究和分子遺傳育種等研究工作具有重要的意義,而且對研究具有重要藥用價值的多倍體藥用菊花——杭白菊具有重大的參考價值,?!痹撠撠?zé)人表示,他們在全球率先使用納米孔測序這一最新的測序技術(shù),,完成了高等植物中全基因組測序,,并克服了之前在二代測序技術(shù)時代解決不了的高雜合、高重復(fù)基因組組裝的難題,,此舉必將極大推動植物基因組,、尤其是藥用植物基因組研究的發(fā)展,是本草基因組學(xué)研究的一項重要突破。