原標(biāo)題:馬來(lái)穿山甲不是新冠病毒中間宿主,,或是類(lèi)似病毒潛在自然宿主
◎科技日?qǐng)?bào)記者趙漢斌
記者24日從云南大學(xué)獲悉,該校省部共建云南生物資源保護(hù)與利用國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室張志剛團(tuán)隊(duì)一項(xiàng)關(guān)于馬來(lái)穿山甲不是新冠病毒中間宿主,,而可能是與新冠病毒類(lèi)似的病毒潛在自然宿主的研究結(jié)果,,近日在Cell子刊《當(dāng)前生物學(xué)》上正式發(fā)表,。
圖片來(lái)源:云南大學(xué)省部共建云南生物資源保護(hù)與利用國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室
今年2月2日,張志剛研究員帶領(lǐng)的團(tuán)隊(duì)對(duì)來(lái)自2019年3月24日無(wú)法救護(hù)成功的一只穿山甲肺樣本病毒組學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行重新組裝和全面分析,,發(fā)現(xiàn)其攜帶有與新冠病毒相近的冠狀病毒,,被命名為穿山甲冠狀病毒(Pangolin-CoV),這種病毒與新冠病毒以及武漢病毒所石正麗團(tuán)隊(duì)報(bào)道的蝙蝠冠狀病毒的基因組相似性分別為91.02%和90.55%,。
研究發(fā)現(xiàn),,穿山甲冠狀病毒與新冠病毒的親緣關(guān)系僅次于蝙蝠冠狀病毒,但是穿山甲冠狀病毒與新冠病毒的S1功能基序高度一致,,涉及與人類(lèi)ACE2受體互作的五個(gè)關(guān)鍵氨基酸殘基完全一致,,而蝙蝠冠狀病毒發(fā)生了四個(gè)突變,提示了穿山甲冠狀病毒與新冠病毒具有相似的宿主細(xì)胞識(shí)別能力,。研究還發(fā)現(xiàn)在S1/S2酶切位點(diǎn),,新冠病毒含有中東呼吸綜合征冠狀病毒類(lèi)似的Furin蛋白識(shí)別序列,,而穿山甲冠狀病毒、蝙蝠冠狀病毒以及SARS冠狀病毒都缺失了該功能基序,,表明新冠病毒與中東呼吸綜合征冠狀病毒具有相似的宿主細(xì)胞侵入機(jī)制,。
相關(guān)研究進(jìn)展于2月15日第一時(shí)間上報(bào)到科技部“新型冠狀病毒感染的肺炎疫情應(yīng)急攻關(guān)項(xiàng)目”,預(yù)印本于2月20日在bioRXiv上公布,。2月26日,,《自然-新聞》作了引用報(bào)道。3月19日Cell子刊《當(dāng)代生物系》以“馬來(lái)穿山甲可能是類(lèi)新冠病毒的潛在自然宿主”為題正式發(fā)表,,研究數(shù)據(jù)可在相關(guān)平臺(tái)上自由獲取,。
此前,武漢病毒所石正麗研究員報(bào)道的蝙蝠冠狀病毒RaTG13與新冠病毒的基因組相似性約96%,,證明了中菊頭蝠是新冠病毒的潛在自然源頭,。張志剛研究員告訴科技日?qǐng)?bào)記者,由于穿山甲冠狀病毒與新冠病毒的基因組相似性沒(méi)有達(dá)到中間宿主所要求的99%或以上相似性,,證明了穿山甲冠狀病毒與新冠病毒不是同一個(gè)病毒,,只是類(lèi)新冠病毒;同時(shí)也證明,,穿山甲不是新冠病毒的中間宿主,,而是新冠病毒的可能潛在自然宿主。
馬來(lái)穿山甲(Manis javanica)地理分布,。圖源:https://www.wikiwand.com/en/Sunda_pangolin
今年2月7日,,華南農(nóng)業(yè)大學(xué)曾召開(kāi)新聞發(fā)布會(huì)宣布,他們通過(guò)對(duì)病毒基因組分析,,發(fā)現(xiàn)穿山甲體內(nèi)分離的病毒株與目前感染人的新冠病毒毒株序列相似度高達(dá)99%,,穿山甲是新冠病毒的“潛在中間宿主”。隨后的研究證實(shí),,華南農(nóng)業(yè)大學(xué)上述報(bào)道是誤報(bào),,并釋放出相似度為90.3%的修正數(shù)據(jù);同時(shí),,香港大學(xué)管軼團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)的證據(jù)為92.4%?!皫讉€(gè)團(tuán)隊(duì)的研究樣本均來(lái)自2019年3月廣東海關(guān)曾截獲的同一批走私穿山甲,。修正后的數(shù)據(jù)與我們的數(shù)據(jù)比較接近?!睆堉緞傉f(shuō),。
綜合各方的研究表明,中菊頭蝠,、馬來(lái)穿山甲只是可能的潛在自然源頭宿主,,考慮與新冠病毒與中東呼吸綜合征冠狀病毒類(lèi)似的一個(gè)涉及病毒感染的基因位點(diǎn),,甚至也可能是其他未發(fā)現(xiàn)的自然源頭宿主,無(wú)論是蝙蝠冠狀病毒,、穿山甲冠狀病毒或其他可能尚未發(fā)現(xiàn)的自然源頭宿主攜帶的冠狀病毒,,通過(guò)哪類(lèi)中間宿主進(jìn)化,再傳到人類(lèi)尚且不知,,目前無(wú)法確定新冠病毒的中間宿主和自然源頭宿主,。
張志剛研究團(tuán)隊(duì)認(rèn)為,從目前發(fā)現(xiàn)的中菊頭蝠,、馬來(lái)穿山甲兩個(gè)可能的潛在源頭宿主分布區(qū)來(lái)看,,中國(guó)華南也只是目前發(fā)現(xiàn)的可能潛在自然宿主之一的中菊頭蝠的部分分布區(qū),現(xiàn)有研究不能確定新冠病毒的發(fā)生地,,更不能表明新冠病毒起源于中國(guó),。
中菊頭蝠(Rhinolophus affinis)的地理分布
圖源:https://www.thainationalparks.com/species/rhinolophus-affinis
“假如中菊頭蝠、馬來(lái)穿山甲這兩個(gè)可能的潛在自然源頭宿主,,能被證明的確是新冠病毒的自然源頭宿主,,那么它們現(xiàn)在的自然分布區(qū),都可能是新冠病毒的發(fā)生地,。而至關(guān)重要的,,是中間宿主是什么?在哪兒發(fā)生,?為何在武漢爆發(fā),?更是未來(lái)科學(xué)研究的核心?!睆堉緞傉f(shuō),。
這項(xiàng)研究還首次全面澄清了新冠病毒與穿山甲冠狀病毒、蝙蝠冠狀病毒,、SARS冠狀病毒以及中東呼吸綜合征冠狀病毒的關(guān)系,,認(rèn)為在蝙蝠和穿山甲之外,新冠病毒存在其它未知中間宿主,,這為進(jìn)一步攻克病毒源頭和傳播路徑提供了重要參考,。
對(duì)未來(lái)新冠病毒的溯源,張志剛研究團(tuán)隊(duì)建議,,可集中到與走私馬來(lái)穿山甲交叉分布的蝙蝠,、食肉動(dòng)物以及偶蹄類(lèi)動(dòng)物、嚙齒類(lèi)類(lèi)動(dòng)物及其自然分布區(qū)展開(kāi)全面調(diào)查采樣,,以及集中到與中菊頭蝠交叉分布的食肉動(dòng)物,、偶蹄類(lèi)動(dòng)物、嚙齒類(lèi)動(dòng)物及其自然分布區(qū)展開(kāi)全面調(diào)查采樣,。
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