基因測(cè)序證實(shí)猴痘已在歐洲發(fā)生大規(guī)模社區(qū)傳播(2)

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2022-05-29 08:51:59 澎湃新聞

此前，葡萄牙國(guó)家衛(wèi)生研究所的約翰.保羅.戈麥斯（Joo Paulo Gomes）及其同事已公布了10份葡萄牙猴痘患者攜帶的猴痘病毒基因組測(cè)序報(bào)告,，并分析指出,，本輪猴痘疫情暴發(fā)極有可能來自一個(gè)源頭。

當(dāng)?shù)貢r(shí)間5月27日,，意大利研究團(tuán)隊(duì)公布了第一份意大利猴痘患者的病毒樣本基因組測(cè)序報(bào)告,。該33歲男子5月18日由葡萄牙抵達(dá)意大利,因肛周潰瘍、雙邊腹股溝淋巴結(jié)腫大,、雙肘部,、背部、臀部和左腳少量丘疹和水泡性皮膚病變前往當(dāng)?shù)蒯t(yī)院就診,，出現(xiàn)皮損前幾天,，患者發(fā)熱(38.5°C)持續(xù)一天，伴有咽痛和打噴嚏,。研究團(tuán)隊(duì)對(duì)該病例攜帶的病毒樣本基因組測(cè)序使用了Illumina平臺(tái),，測(cè)序深度為19倍。分析結(jié)果顯示,，該患者攜帶的猴痘病毒基因組屬于西非進(jìn)化支,，與葡萄牙團(tuán)隊(duì)上傳的基因組樣本關(guān)系極為密切。

同一天,，西班牙團(tuán)隊(duì)公布了西班牙第一份猴痘病毒樣本基因組測(cè)序報(bào)告,。基因組草圖的覆蓋率為98.6%,，平均測(cè)序深度為77倍,。該病毒基因組同屬猴痘病毒西非進(jìn)化支，與關(guān)系最密切的葡萄牙一支序列相比,，單核苷酸多樣性位點(diǎn)(SNPs)小于4個(gè),，與德國(guó)序列相比，單核苷酸多樣性位點(diǎn)(SNPs)為2個(gè),。

荷蘭的研究團(tuán)隊(duì)在此前一天,，公布了首份荷蘭猴痘病毒樣本基因組序列報(bào)告，團(tuán)隊(duì)使用了Nanopore基因測(cè)序平臺(tái)，測(cè)序深度為10倍,。研究者在報(bào)告中稱,，病毒在進(jìn)化樹上與此前葡萄牙團(tuán)隊(duì)公布的基因組樣本極為相似，與關(guān)系最為密切的一份葡萄牙樣本相比,，只出現(xiàn)了2個(gè)單核苷酸多樣性位點(diǎn)(SNP s)。

此外,，來自法國(guó)的第一份病毒基因組序列,，比利時(shí)的第二份病毒基因組序列都表現(xiàn)出了與葡萄牙最早公布的基因序列極高的相似度，且都屬于病毒基因進(jìn)化樹上的西非分支,。

意大利研究團(tuán)隊(duì)進(jìn)一步表示,，“目前的基因組測(cè)序結(jié)果進(jìn)一步支持了這樣的結(jié)論，即猴痘病毒在歐洲已經(jīng)發(fā)生了大規(guī)模的社區(qū)傳播,。”

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