開通運(yùn)營初期,，穗深城際鐵路每日最多開行37趟動車組列車,，其中廣州東站往返深圳機(jī)場站33趟，新塘南站往返深圳機(jī)場站4趟,。日常開行33趟,，其中廣州東站往返深圳機(jī)場站29趟，新塘南站往返深圳機(jī)場站4趟,。

公交化運(yùn)營

穗深城際鐵路主要連接廣州,、深圳和東莞的中心區(qū),，采取公交化運(yùn)營模式，所有座位不對號入座,，且車票為電子票，旅客可以隨時買票隨時出行,，和坐地鐵一樣方便,，被旅客們譽(yù)為“高級地鐵”。

穗深城際搭載量更大

旅客刷身份證進(jìn)站。