“然而它還沒有達(dá)到模糊病毒與細(xì)菌概念的程度,，”劉軍持不同觀點(diǎn),，病毒與細(xì)菌的界限并不是用大小來定義的。

病毒的生命活動嚴(yán)重依賴宿主細(xì)胞，它通過特異的受體結(jié)合蛋白,，讓細(xì)胞受體“接受”自己,，促使病毒的囊膜與細(xì)胞膜融合，病毒借機(jī)把遺傳物質(zhì)注入宿主細(xì)胞,，借由宿主細(xì)胞內(nèi)的“原料”開始自我復(fù)制,，裝配新病毒而后釋放。而目前發(fā)現(xiàn)的“大”病毒并未跳出這個范圍,。

在生命活動方面，病毒甚至還不及線粒體更“像”單獨(dú)的生命,。線粒體是一種細(xì)胞器,，內(nèi)涵獨(dú)立的DNA遺傳分子，并能夠通過生物化學(xué)反應(yīng),，產(chǎn)生生命活動需要的能量,。

因此，測定基因序列僅僅是研究的第一步,，了解新病毒的關(guān)鍵,，是要確定其表達(dá)了多少蛋白以及蛋白的功能。由于病毒只有在宿主細(xì)胞中才會進(jìn)行基因表達(dá),、基因組復(fù)制和病毒粒子的裝配,，因此研究病毒的活動需要借助于特異性宿主細(xì)胞。

而目前,，人類能夠用特異性宿主細(xì)胞分離的病毒,，相對于自然界存在的病毒庫來講，可以說是少之又少,。因此,，近年來科學(xué)家們借助于快速發(fā)展的深度測序技術(shù)和人工智能技術(shù)發(fā)現(xiàn)新病毒，并對其特征進(jìn)行研究,。

人類認(rèn)識病毒的能力大幅提升

2016年11月,，《自然》雜志發(fā)表中國疾病預(yù)防控制中心傳染病預(yù)防控制所張永振研究員團(tuán)隊(duì)論文《無脊椎動物RNA病毒圈的重新界定》，通過深度轉(zhuǎn)錄組測序在220種無脊椎動物中共計(jì)發(fā)現(xiàn)超過1445種全新的病毒,，其中一些病毒與現(xiàn)有已知病毒的差異性足以把它們定義為新的病毒科,。

RNA病毒圈的重新界定，就是在原有已知RNA病毒種類基礎(chǔ)之上,，發(fā)現(xiàn)大量新的RNA病毒,，展現(xiàn)給人類一個連貫的、模塊化的病毒基因組進(jìn)化模式,，而不是一個支離破碎的病毒分類體系,。

RNA病毒是一大類以RNA而不是DNA作為遺傳物質(zhì)的重要病毒，與人類健康息息相關(guān),，包括艾滋病病毒,、重癥急性呼吸綜合癥（SARS）冠狀病毒,、埃博拉病毒、流感病毒等,，這類病毒變異相對較快,。更值得關(guān)注的是，RNA病毒也經(jīng)常從細(xì)胞生物中獲取基因,，包括RNA解旋酶,、甲基轉(zhuǎn)移酶基因等。

大量新RNA病毒的發(fā)現(xiàn)及其特征研究為完整地了解病毒與宿主的的相互作用和共進(jìn)化史研究提供了堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ),。

而在《自然》雜志近日發(fā)布的一則消息中,，研究人員利用人工智能（AI）發(fā)現(xiàn)了近6000種未知的病毒。

研究人員通過對來自不同環(huán)境的樣本進(jìn)行深度測序,，通過匹配“特定序列”來尋找未知的病毒,。但需要特定序列作為“檢索詞”，更多時候檢索詞未知,，就難以尋找,。而機(jī)器學(xué)習(xí)通過算法解析數(shù)據(jù)，從中學(xué)習(xí),，然后自主分類信息,，可以解決“檢索詞”未知的問題。

美國能源部聯(lián)合基因組研究所（JGI）的計(jì)算生物學(xué)家 Simon Roux 訓(xùn)練計(jì)算機(jī)識別不常見的 Inoviridae 病毒科的基因序列,。Roux提出了一種機(jī)器學(xué)習(xí)算法,，其中包含兩組數(shù)據(jù)：其中一組含有來自已知的Inoviridae的805個基因組序列，另一個含有來自細(xì)菌和其他類型病毒的約2000個序列,。該算法可以幫助找到區(qū)分這兩種序列的方法,。

接下來，Roux向模型上傳大量宏基因組學(xué)數(shù)據(jù),，通過該模型的計(jì)算,，發(fā)現(xiàn)了該數(shù)據(jù)中包含超過10000個Inoviridae基因組，并可將其分成不同的病毒種,，并且,，其中一些病毒種類之間的差異如此之大，以至于可能定義新的病毒科,。

“隨著人類認(rèn)識病毒和研究病毒的技術(shù)不斷發(fā)展,，更多新奇的病毒形態(tài)正在發(fā)現(xiàn)的路上，”劉軍說,，“這些發(fā)現(xiàn)將有助于人們構(gòu)建病毒的檢測與監(jiān)測體系,，也有助于提高對由未知病原體引起的傳染病或者說近期世界衛(wèi)生組織提到的X疾病的認(rèn)識，從而做到針對性的預(yù)防和控制,?！?/p>

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