新京報(bào)訊(記者周懷宗)近日,,記者從中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院獲悉,,一種研究土壤微生物群落的新策略被提出,這一策略由該院農(nóng)業(yè)資源與農(nóng)業(yè)區(qū)劃研究所植物營(yíng)養(yǎng)團(tuán)隊(duì)提出,,相關(guān)成果發(fā)表在《土壤生物學(xué)與生物化學(xué)(Soil Biology & Biochemistry)》上。
相對(duì)定量(RMP)和絕對(duì)定量(AMP)方法對(duì)微生物群落結(jié)構(gòu)分析的差異,。中國(guó)農(nóng)科院供圖
微生物群落的組成和功能在人類(lèi)健康,、全球元素循環(huán),、作物生長(zhǎng)和植物抗病中發(fā)揮關(guān)鍵作用。隨著高通量測(cè)序等技術(shù)的革命性突破,,極大地增加了我們對(duì)微生物多樣性、群落結(jié)構(gòu)和物種組成的認(rèn)識(shí),。
不過(guò),,研究人員介紹,測(cè)序數(shù)據(jù)僅提供微生物群落的相對(duì)豐度變化,,忽略了微生物絕對(duì)數(shù)量的變化規(guī)律,。針對(duì)高通量測(cè)序數(shù)據(jù)的這一缺陷,研究人員已經(jīng)開(kāi)發(fā)出多種微生物絕對(duì)豐度定量方法,,例如,,內(nèi)參法、熒光定量法與高通量測(cè)序結(jié)合,、流式細(xì)胞儀與高通量測(cè)序結(jié)合等,。然而,這些定量方法的普遍適用性和精確度尚不清楚,。
在此次研究中,,團(tuán)隊(duì)利用采自黑龍江海倫和海南三亞的兩類(lèi)差異較大的土壤樣品,,評(píng)估了土壤微生物研究中最常用的兩種絕對(duì)定量方法內(nèi)參法和熒光定量法與高通量測(cè)序結(jié)合的方法。結(jié)果表明:內(nèi)參法在準(zhǔn)確性,、穩(wěn)定性和工作量等方面沒(méi)有顯示出任何優(yōu)勢(shì),。相比之下,更常用的熒光定量法與高通量測(cè)序結(jié)合的方法對(duì)探究環(huán)境擾動(dòng)對(duì)土壤微生物動(dòng)力學(xué)的影響提供了有價(jià)值的見(jiàn)解,??紤]其穩(wěn)定性和技術(shù)可行性,熒光定量法與高通量測(cè)序結(jié)合方法可廣泛應(yīng)用于土壤微生物群落的定量研究,。
新京報(bào)記者周懷宗