2019新型冠狀病毒效果圖
來(lái)源:美國(guó)疾控中心官網(wǎng)
專(zhuān)家對(duì)新冠病毒基因組的兩大顯著特征進(jìn)行了比較分析,這些分析提供了大量證據(jù)推論出:新冠病毒不太可能是實(shí)驗(yàn)室基因工程制造的病毒,而應(yīng)該是病毒自然進(jìn)化的產(chǎn)物,。
本報(bào)記者 劉園園
疫情當(dāng)頭,關(guān)于2019新型冠狀病毒來(lái)自實(shí)驗(yàn)室泄露的傳聞此起彼伏,。
日前,,5位國(guó)外科學(xué)家在病毒學(xué)論壇“Virological”共同發(fā)布論文,對(duì)2019新型冠狀病毒的基因組數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,,指出2019新型冠狀病毒不是實(shí)驗(yàn)室合成的,也不是一種被故意操縱的病毒,。目前,,論文還未經(jīng)過(guò)正式的同行評(píng)議。
這5位科學(xué)家包括美國(guó)哥倫比亞大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院感染與免疫中心主任,、被譽(yù)為“病毒獵手”的伊恩·利普金,。此外還有4位來(lái)自美國(guó)斯克里普斯研究所、英國(guó)愛(ài)丁堡大學(xué),、澳大利亞悉尼大學(xué),、美國(guó)杜蘭大學(xué)的生物學(xué)或免疫學(xué)研究人員,。
論文指出,與其他冠狀病毒相比,,2019新型冠狀病毒的基因組存在兩個(gè)顯著特征,。隨后文章從這兩大特征入手,分析了為何2019新型冠狀病毒不太可能來(lái)自實(shí)驗(yàn)室合成,。
S蛋白與受體的結(jié)合方案,,不同于人工預(yù)測(cè)
2019新型冠狀病毒的第一個(gè)特征是,根據(jù)結(jié)構(gòu)模型和早期生化實(shí)驗(yàn),,這種病毒似乎為了結(jié)合人類(lèi)的ACE2受體而得到優(yōu)化,。
這里有必要科普一下,此前有研究發(fā)現(xiàn),,2019新型冠狀病毒和SARS病毒都是通過(guò)刺突蛋白(S蛋白)與人體ACE2受體結(jié)合,,介導(dǎo)病毒進(jìn)入人體細(xì)胞。
中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究所副所長(zhǎng),、北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院免疫學(xué)系副主任黃波介紹,,S蛋白是位于冠狀病毒表面的一種蛋白,放大后像釘子,。ACE2則是位于人體肺部上皮細(xì)胞表面的一種蛋白,。
這些國(guó)外專(zhuān)家提出:“SARS病毒和SARS相關(guān)冠狀病毒S蛋白中的受體結(jié)合域(RBD)是病毒基因組中最容易變異的部分。這些受體結(jié)合域中的6個(gè)殘基似乎對(duì)與人體ACE2受體結(jié)合以及確定宿主范圍至關(guān)重要,?!?/p>
論文中說(shuō),2019新型冠狀病毒S蛋白基因序列中486殘基處的苯丙氨酸,,與SARS病毒S蛋白基因序列中的L472相對(duì)應(yīng),。在SARS病毒細(xì)胞培養(yǎng)實(shí)驗(yàn)中,L472可以突變?yōu)楸奖彼?。此前的研究預(yù)測(cè),,這是SARS病毒的受體結(jié)合域與人體ACE2受體結(jié)合的最佳方案。然而,,這種位置的苯丙氨酸也存在于蝙蝠身上的一些類(lèi)SARS冠狀病毒中,。
此外,2019新型冠狀病毒受體結(jié)合域中的幾個(gè)關(guān)鍵殘基,,與之前研究曾描述的與人體ACE2受體結(jié)合的最佳殘基不一樣,。但最新研究卻表明,2019新型冠狀病毒與人體ACE2結(jié)合的親和力很高,。
這說(shuō)明什么,?“2019新型冠狀病毒的S蛋白似乎是對(duì)人或類(lèi)似人ACE2的自然選擇的結(jié)果,從而出現(xiàn)了不同于預(yù)測(cè)的最佳結(jié)合方案,。這有力地證明了2019新型冠狀病毒不是基因工程的產(chǎn)物,?!闭撐淖髡叻Q。
S蛋白上的酶切位點(diǎn),,可以通過(guò)自然變異獲得
2019新型冠狀病毒的第二個(gè)特征是,,在這種病毒具有高度變異性的S蛋白上,插入了12個(gè)核苷酸,,而且存在一個(gè)可疑的酶切位點(diǎn),。
“通常情況下,存在這樣的酶切位點(diǎn)被看作人工基因工程的痕跡,。但是對(duì)禽流感病毒的研究發(fā)現(xiàn),,病毒在自然進(jìn)化的過(guò)程中,也可以獲得酶切位點(diǎn),?!蹦祥_(kāi)大學(xué)生命科學(xué)院副教授高山的研究方向?yàn)樯镄畔W(xué),他在接受科技日?qǐng)?bào)記者采訪時(shí)如是說(shuō),。
上述論文提到,,這種酶切位點(diǎn),在病毒快速?gòu)?fù)制和傳播的自然選擇環(huán)境下,,例如在高度密集的雞群中,,可以在禽流感病毒血凝素(HA)蛋白的兩個(gè)亞基的接合處獲得。流感病毒HA蛋白在細(xì)胞培養(yǎng)或動(dòng)物體內(nèi)反復(fù)強(qiáng)制傳代后,,也可以觀察到酶切位點(diǎn)的獲得,。
論文提出,通過(guò)插入或重組而獲得HA蛋白中的酶切位點(diǎn),,可將低致病性禽流感病毒轉(zhuǎn)化為高致病性禽流感病毒,。同樣,新城疫病毒的一個(gè)無(wú)毒分離物在雞的連續(xù)傳代過(guò)程中,,可以在其融合蛋白亞基的連接處逐漸獲得一個(gè)酶切位點(diǎn),,從而變得高度致病。
“這意味著,,一旦獲得酶切位點(diǎn),,這些病毒相當(dāng)于進(jìn)行了一次升級(jí),有可能提高其傳染能力,?!备呱秸f(shuō)。
與這篇國(guó)外專(zhuān)家的論文遙相呼應(yīng),,早在1月27日,高山就與多位研究人員共同在中科院科技論文預(yù)發(fā)布平臺(tái)ChinaXiv上提交研究發(fā)現(xiàn):2019新型冠狀病毒S蛋白可能存在弗林(Furin)蛋白酶切位點(diǎn),。
高山介紹,,他們的研究發(fā)現(xiàn),,2019新型冠狀病毒的S蛋白可能存在弗林蛋白酶切位點(diǎn),從而導(dǎo)致它的感染機(jī)制不同于SARS等大部分β冠狀病毒,。由于感染機(jī)制的改變,,2019新型冠狀病毒獲得了更高的進(jìn)入細(xì)胞的效率,這可能是其傳播能力大于SARS病毒的原因之一,。
“我們還意外地發(fā)現(xiàn),,一些禽流感病毒可以通過(guò)突變獲得弗林蛋白酶切位點(diǎn),這說(shuō)明自然突變可以引入弗林蛋白酶切位點(diǎn),?!备呱秸f(shuō)。
O-聚糖結(jié)構(gòu)的產(chǎn)生,,通常需要免疫系統(tǒng)參與
“2019新型冠狀病毒不太可能是通過(guò)實(shí)驗(yàn)室操作現(xiàn)有的SARS相關(guān)冠狀病毒而出現(xiàn)的,。”這些國(guó)外專(zhuān)家說(shuō),。
專(zhuān)家們指出,,如果進(jìn)行了基因操縱,人們可以預(yù)期,,可用于β冠狀病毒的幾個(gè)反向遺傳系統(tǒng)中的一個(gè)將被使用,。然而,情況并非如此,,因?yàn)檫z傳數(shù)據(jù)顯示,,2019新型冠狀病毒并非來(lái)自任何先前使用的病毒主干。
這幾位國(guó)外專(zhuān)家提出了兩種可能的情況來(lái)解釋2019新型冠狀病毒的起源:第一種是在人畜共患傳染病轉(zhuǎn)移之前,,在非人類(lèi)動(dòng)物宿主中自然選擇的結(jié)果,;第二種是在人畜共患傳染病轉(zhuǎn)移之后,在人類(lèi)中自然選擇的結(jié)果,。
那么,,實(shí)驗(yàn)室到底有沒(méi)有能力設(shè)計(jì)或合成病毒?“從技術(shù)上講,,是沒(méi)有問(wèn)題的,。”高山告訴科技日?qǐng)?bào)記者,。
對(duì)此,,這篇國(guó)外論文也進(jìn)行了分析?!岸嗄陙?lái),,在世界各地的多個(gè)BSL-2(生物安全第二等級(jí))實(shí)驗(yàn)室都進(jìn)行了有關(guān)蝙蝠SARS樣冠狀病毒在細(xì)胞培養(yǎng)和/或動(dòng)物模型中傳代的基礎(chǔ)研究。還記錄了在BSL-2密閉環(huán)境下工作的實(shí)驗(yàn)室人員在實(shí)驗(yàn)室獲得SARS病毒的實(shí)例。因此,,我們必須考慮有意或無(wú)意釋放2019新型冠狀病毒的可能性,。”論文稱,。
但專(zhuān)家們隨后對(duì)這種可能性也進(jìn)行了質(zhì)疑,。
他們指出,通過(guò)細(xì)胞培養(yǎng)或動(dòng)物傳代產(chǎn)生2019新型冠狀病毒,,需要事先分離具有高度遺傳相似性的前體病毒,。隨后產(chǎn)生的酶切位點(diǎn)需要在細(xì)胞培養(yǎng)中,或者具有與人類(lèi)相似的ACE2受體的動(dòng)物(如雪貂)中進(jìn)行密集的傳代程序,。
然而,,2019新型冠狀病毒S蛋白由于存在酶切位點(diǎn),導(dǎo)致酶切位點(diǎn)周?chē)嬖?個(gè)O-聚糖結(jié)構(gòu),?!爸档脩岩傻氖牵琌-聚糖結(jié)構(gòu)的產(chǎn)生是否會(huì)發(fā)生在細(xì)胞培養(yǎng)過(guò)程中,,因?yàn)檫@種突變通常意味著免疫系統(tǒng)的參與,,而這種免疫系統(tǒng)在體外是不存在的?!边@些國(guó)外專(zhuān)家稱,。
這個(gè)春節(jié),,一場(chǎng)始料未及的新冠肺炎疫情,,打亂了人們對(duì)于鼠年的憧憬,,不斷滾動(dòng)的疫情播報(bào)牽動(dòng)著每個(gè)人的心