復(fù)旦團(tuán)隊(duì)創(chuàng)建精準(zhǔn)N糖蛋白質(zhì)組學(xué)分析方法

央廣網(wǎng)上海9月6日消息（記者傅聞捷）近日,，復(fù)旦大學(xué)生物醫(yī)學(xué)研究院和化學(xué)系教授楊芃原團(tuán)隊(duì),、中國(guó)科學(xué)院計(jì)算技術(shù)研究所研究員賀思敏團(tuán)隊(duì)以及國(guó)家蛋白質(zhì)科學(xué)中心（上海）研究員黃超蘭團(tuán)隊(duì)合作，發(fā)表了基于質(zhì)譜的高通量糖基化肽段分析方法pGlyco2.0,，為精準(zhǔn)N糖蛋白質(zhì)組學(xué)提供了新技術(shù),。

昨天,，相關(guān)研究成果以《pGlyco2.0：基于綜合質(zhì)控和一步質(zhì)譜法的精準(zhǔn)N糖蛋白質(zhì)組學(xué)糖肽分析方法》（pGlyco 2.0 enables precision N-glycoproteomics with comprehensive quality control and one-step mass spectrometry for intact glycopeptide identification）為題在《自然·通訊》（Nature Communications）上發(fā)表。楊芃原,、賀思敏和黃超蘭為共同通訊作者,。楊芃原為該文的Lead Contact。

　　pGlyco2.0流程圖

糖基化是最復(fù)雜的蛋白后修飾之一,。與其他蛋白后修飾相比,，糖基化不但會(huì)產(chǎn)生宏觀不均一性（每個(gè)蛋白上可能有多個(gè)后修飾位點(diǎn)），更會(huì)產(chǎn)生海量的微觀不均一性（每個(gè)位點(diǎn)上可能有幾十甚至上百種不同的后修飾基團(tuán)）,。除此之外,，糖鏈本身的離子化效率很低。這些因素的結(jié)合使得糖基化分析的通量和質(zhì)量遠(yuǎn)低于蛋白質(zhì)組學(xué)的常規(guī)分析水平,。

該研究通過(guò)深入研究和測(cè)試質(zhì)譜條件,，開(kāi)發(fā)基于階梯能量的一步質(zhì)譜采集法，提高了糖肽鑒定的通量和開(kāi)發(fā)具有自主產(chǎn)權(quán)的pGlyco2.0糖肽檢索引擎,，從糖鏈,、肽段、糖肽三個(gè)層面對(duì)糖肽數(shù)據(jù)庫(kù)檢索進(jìn)行精確質(zhì)控,，從而大幅提升了N糖蛋白質(zhì)組學(xué)分析的通量和質(zhì)量,。

　　基于重標(biāo)技術(shù)的糖肽質(zhì)控新方法

此外，該研究首次將重標(biāo)元素應(yīng)用于糖肽鑒定準(zhǔn)確度分析,，為該領(lǐng)域的質(zhì)控分析提供了新的方法及標(biāo)準(zhǔn),。最后，該研究報(bào)道了目前最大的糖基化數(shù)據(jù)集：在1%的假陽(yáng)性率下,，該研究在小鼠的五個(gè)臟器種鑒定到了超過(guò)一萬(wàn)條N糖肽,。