原標(biāo)題：新研究：龜類也可能是新冠病毒潛在中間宿主

目前，新冠病毒已致我國(guó)數(shù)萬(wàn)人感染，上千人喪生,，并蔓延至全球20多個(gè)國(guó)家,。確認(rèn)中間宿主對(duì)阻止病毒的進(jìn)一步傳播至關(guān)重要。

此前,，研究人員先后提出蝙蝠或是新冠病毒自然宿主,，蛇、穿山甲可能是潛在中間宿主,。

2月26日,，湖北醫(yī)藥學(xué)院附屬人民醫(yī)院的劉龍聯(lián)合廣州暨南大學(xué)吳建國(guó)課題組在《醫(yī)學(xué)病毒學(xué)雜志》上發(fā)表論文稱，龜類（西部錦龜,、綠海龜,、中華鱉）也可能是將新冠病毒傳播給人類的潛在中間宿主。

最新研究采用冠狀病毒刺突蛋白和宿主ACE2受體的組成和差異，預(yù)測(cè)SARS-CoV-2的潛在中間宿主,。

該研究的重點(diǎn)是比較 SARS CoV-2 與 SARS-CoV,、蝙蝠 SARS 樣 CoV 和其他冠狀病毒之間的刺突序列。這有助于進(jìn)行進(jìn)化分析,，并尋找可能的病毒庫(kù),。此外，對(duì) ACE2 結(jié)構(gòu)和結(jié)合基序比對(duì)的分析,，有助于提供線索來區(qū)分潛在宿主,。

SARS-CoV-2編碼至少27種蛋白質(zhì)，包括15種非結(jié)構(gòu)蛋白,、4種結(jié)構(gòu)蛋白和8種輔助蛋白,。刺突蛋白（S）是一種結(jié)構(gòu)蛋白，位于病毒體的外殼上,，負(fù)責(zé)與宿主受體血管緊張素轉(zhuǎn)換酶2（ACE2）結(jié)合,。研究刺突蛋白中受體結(jié)合區(qū)域（RBD）序列的進(jìn)化關(guān)系有助于理解病毒起源趨勢(shì)。

研究結(jié)果表明,，蝙蝠 SARS 樣 CoV RaTG13 與 SARS-CoV-2 整體基因組具有 96.2% 的序列同一性,。值得注意的是，SARS-CoV 是穿山甲標(biāo)本中分布最廣的冠狀病毒,。

刺突RBD受體相互作用是決定冠狀病毒宿主范圍的關(guān)鍵因素,。研究組對(duì)來自SARS-CoV、蝙蝠或穿山甲SARS樣CoV和SARS-CoV-2的刺突蛋白的RBD序列進(jìn)行了比對(duì),。

蝙蝠SARS樣CoV從第473到第490個(gè)殘基缺失,，位于外部亞結(jié)構(gòu)域，似乎可以確定這些病毒不會(huì)自然感染人,。目前并沒有直接證據(jù)表明,，蝙蝠SARS樣CoV曾感染人類。

穿山甲 SARS 樣 CoV SRR10168377 與蝙蝠 SARS 樣 CoV RaTG13 僅具有 85% 的同一性,。這表明如果只關(guān)注刺突 RBD,，穿山甲 SARS 樣 CoV SRR10168377 有可能越過宿主屏障感染人類。

類似 SARS-CoV 與人 ACE2 的結(jié)合,，受體上的 31,、41、82,、353,、355 和 357 位殘基在與 SARS CoV-2 刺突蛋白相互作用時(shí)會(huì)定位到表面。

從具有ACE2受體41和353位的RBD域中的Asn501來看,，龜類和穿山甲似乎比蝙蝠更接近人類,。這表明龜類和穿山甲可能是SARS-CoV-2的潛在擴(kuò)展宿主,。

了解結(jié)構(gòu)結(jié)合機(jī)制將有助于找到準(zhǔn)確的病毒庫(kù)，并有助于制定預(yù)防對(duì)策,。通過冷凍電子顯微鏡緊急分析 SARS-CoV-2 刺突蛋白的結(jié)晶體,，有助于驗(yàn)證 SARS CoV-2 刺突 RBD 與人類 ACE2 或其他宿主受體之間相互作用的結(jié)合點(diǎn)。

據(jù)報(bào)道,，SARS-CoV-2刺突蛋白與ACE2的結(jié)合能力比SARS-CoV強(qiáng)得多,。這表明SARS-CoV-2的中間宿主更多。

目前已知龜類作為病毒庫(kù),，攜帶數(shù)十種病毒,，包括虹蛙病毒（RV）、尼多病毒（NV）,、乳頭瘤病毒（PV）,、甲魚虹彩病毒（STIV）、甲魚系統(tǒng)性敗血癥球狀病毒（STSSSV）,、龜細(xì)小核糖核酸病毒（ToPV）和中華鱉出血綜合征病毒（TSHSV）,。不能排除蝙蝠 SARS 樣 CoV RaTG13 或其他 SARS 樣 CoV 感染龜類，并在進(jìn)化后向人傳播,。

從SARS-CoV和MERS-CoV到SARS-CoV-2,，蝙蝠均是冠狀病毒的天然宿主，但中間宿主卻各不相同,。此前研究表明，與其他動(dòng)物相比,，蛇因其同義密碼子相對(duì)使用度（RSCU）偏向,，很有可能是SARS-CoV-2的野生動(dòng)物病毒庫(kù)。

果子貍和單峰駱駝作為人畜共患病SARS-CoV和MERS-CoV的中間宿主,，生活在不同的時(shí)空環(huán)境,，但它們?nèi)詫⒐跔畈《緜鞑ソo人類。這使得短期內(nèi)找到SARS-CoV-2的中間宿主很難,。

病毒受體結(jié)合序列和宿主受體的分析有助于快速靶向SARS-CoV-2可能的中間宿主,。與非法交易的穿山甲相比，市場(chǎng)上的龜類更普遍受歡迎,。

總之,，該研究提供了一些信息，即與蛇和穿山甲一樣,，龜類（西部錦龜,、綠海龜、中華鱉）亦可能是將SARS-CoV-2傳播給人類的潛在中間宿主,，但仍需進(jìn)一步研究來確認(rèn),。

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1月22日，北京大學(xué)團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)新型冠狀病毒與蛇具有相似的密碼子使用偏倚，推斷蛇可能是潛在中間宿主,。

2.蝙蝠

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3.穿山甲

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2月20日,，香港大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院教授管軼在穿山甲樣本中發(fā)現(xiàn)了冠狀病毒，再次表明穿山甲應(yīng)被視為新型冠狀病毒的可能中間宿主,。