新京報(bào)訊（記者趙利新）近日,，記者從河南農(nóng)業(yè)大學(xué)得悉,，該校馮建燦教授領(lǐng)銜的桃生物學(xué)與種質(zhì)創(chuàng)新團(tuán)隊(duì),，前后歷時(shí)八年時(shí)間,，完成了溫度敏感型半矮化桃基因組de novo組裝，發(fā)布了高質(zhì)量桃樹參考基因組,，并結(jié)合雜交群體重測(cè)序及轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,，解析了桃溫度敏感型半矮化樹型等農(nóng)藝性狀形成機(jī)制。

桃樹生產(chǎn)存在的主要問題是用工量大,，人工成本約占果品成本的60%,，整形修剪幾乎全部由人工完成。馮建燦教授團(tuán)隊(duì)針對(duì)桃產(chǎn)業(yè)中存在的“卡脖子”問題,，積極開展桃種質(zhì)資源創(chuàng)新與樹體結(jié)構(gòu)等重要農(nóng)藝性狀功能基因發(fā)掘等研究工作,，希望選育出適宜于桃省力化栽培的具有“理想樹型”的桃樹新品種。

“中油桃14”基因組特征圖片,。受訪者供圖

據(jù)悉,，為從遺傳學(xué)角度解析桃溫度溫感型半矮化性狀，馮建燦團(tuán)隊(duì)首先組裝“中油桃14”的高質(zhì)量基因組（圖1）,，并利用構(gòu)建的“黃水蜜”（HSM,，普通型）×CN14的雜交群體，連續(xù)3年性狀觀察統(tǒng)計(jì),，發(fā)現(xiàn)CN14為溫度敏感型半矮化的顯性雜合基因型,，雜交子代中溫度敏感型半矮化與普通型呈現(xiàn)1：1分離；通過對(duì)雜交子代重測(cè)序與表型進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析,，利用GWAS和遺傳圖譜將其定位于3號(hào)染色體,；結(jié)合轉(zhuǎn)錄組發(fā)現(xiàn)定位區(qū)間的PpTIP2基因表達(dá)與溫度敏感型半矮化性狀極其相關(guān)，進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)其啟動(dòng)子變異與表型一致,；進(jìn)而利用啟動(dòng)子活性分析，發(fā)現(xiàn)高溫條件下CN14特異啟動(dòng)子活性顯著高于HSM啟動(dòng)子,，表明CN14特異啟動(dòng)子受溫度誘導(dǎo),，進(jìn)一步表明PpTIP2在溫度敏感型半矮化性狀形成中具有重要作用。此發(fā)現(xiàn)為桃溫度敏感型半矮化性狀高效育種提供理論支撐,，為人工調(diào)節(jié)桃樹生長(zhǎng)發(fā)育和樹型具有重要的意義,。

在植物漫長(zhǎng)的進(jìn)化過程中，個(gè)體形成了極其豐富的遺傳變異,，所以,，單個(gè)基因組不能涵蓋物種的全部遺傳信息，因此,，一個(gè)完整,、準(zhǔn)確的高質(zhì)量基因組對(duì)解析性狀遺傳密碼至關(guān)重要。該研究基于新組裝的CN14基因組,，對(duì)花型,、花徑、果皮茸毛有/無,、果實(shí)成熟期,、近核紅色素和單重瓣等14個(gè)農(nóng)藝性狀進(jìn)行GWAS分析，發(fā)現(xiàn)了一些新的線索,，為進(jìn)一步解析相關(guān)性狀的形成機(jī)理提供新的思路和借鑒意義,。

團(tuán)隊(duì)成員連曉東博士全程參與整個(gè)研究，從最初的雜交群體構(gòu)建,、連續(xù)多年表型觀測(cè),，到通過基因組結(jié)合表型分析找到候選基因，前后歷時(shí)八年,。連博士表示,，科研的路上雖然時(shí)有艱辛，但是有明確的目標(biāo),，有導(dǎo)師馮建燦教授的悉心指導(dǎo)和不斷鼓勵(lì),，持之以恒，通過育種和基礎(chǔ)研究結(jié)合,，相信我們團(tuán)隊(duì)一定能夠培育出適宜省力化栽培的品種,。

新京報(bào)記者趙利新