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研究員為做研究切三萬多個西瓜(4)

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2024-08-07 09:49:38  中國科學報

“我以前皮膚是很白的,，“鄧云笑著說道,，”但是在地里做育種工作這么多年，很難不曬黑，我們團隊其他育種家都和我膚色差不多,。“

接受采訪前，鄧云剛走出北大農研院的育種大棚。

也正是對每份西瓜材料都了如指掌,，才能使他們在后期投稿，面對審稿人質疑“材料不對“時,，第一時間不是自我懷疑,，而是擺出證據(jù)。

他們花費近一個月的時間,，仔細查找材料信息和審稿人的相關文章,，并與種質資源庫負責人進一步核實后，委婉回復了對方,。

“作為一個研究了西瓜四十多年的人,，張興平老師可以說是全世界對西瓜最了解的人?！编囋菩χf,，“我們對材料是非常自信?！?/p>

鄧云（左）和張興平（右）在調查植株生長情況

鄧云（左）和張興平（右）在調查瓜

張興平在調查西瓜,，發(fā)現(xiàn)好的組合

握緊接力棒向構建西瓜屬超級泛基因組圖譜沖刺

構建T2T水平超級泛基因組的過程，如同一場三棒接力賽,。第一棒是深入田間地頭,，種植材料，不斷取樣,，第二棒送樣測序,，第三棒則是數(shù)據(jù)分析。

田間濕透衣服的第一棒完成后,，就到了測序階段,。

應用最先進的HiFi、HiC和,、ONT等三代測序技術,，雖然完成了基因組的初組裝，但是仍然難以做到全部實現(xiàn)T2T和無缺口的組裝,。

2021年底,，隨著李博生加入團隊，利用自己研發(fā)的選擇性測序方法和超長測序技術填補了基因組的存在和端粒,，全部基因組均實現(xiàn)了T2T和無缺口的組裝,。

繼李博生完成測序工作后，何航帶領團隊夜以繼日完成最后沖刺,，常常做數(shù)據(jù)分析做到半夜兩三點,。

每兩周開一次組會，討論進展、分析結果,、分享新的發(fā)現(xiàn),，是接力賽順利完成交接棒的原因。

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