研究員為做研究切三萬多個西瓜(4)
“我以前皮膚是很白的,，“鄧云笑著說道，”但是在地里做育種工作這么多年,，很難不曬黑,，我們團隊其他育種家都和我膚色差不多?！?/p>
接受采訪前,，鄧云剛走出北大農(nóng)研院的育種大棚。
也正是對每份西瓜材料都了如指掌,，才能使他們在后期投稿,，面對審稿人質(zhì)疑“材料不對“時，第一時間不是自我懷疑,，而是擺出證據(jù),。
他們花費近一個月的時間，仔細查找材料信息和審稿人的相關(guān)文章,，并與種質(zhì)資源庫負責人進一步核實后,，委婉回復了對方。
“作為一個研究了西瓜四十多年的人,，張興平老師可以說是全世界對西瓜最了解的人,。”鄧云笑著說,，“我們對材料是非常自信,。”
鄧云（左）和張興平（右）在調(diào)查植株生長情況
鄧云（左）和張興平（右）在調(diào)查瓜
張興平在調(diào)查西瓜,，發(fā)現(xiàn)好的組合
握緊接力棒向構(gòu)建西瓜屬超級泛基因組圖譜沖刺
構(gòu)建T2T水平超級泛基因組的過程,，如同一場三棒接力賽。第一棒是深入田間地頭,，種植材料,，不斷取樣，第二棒送樣測序,，第三棒則是數(shù)據(jù)分析,。
田間濕透衣服的第一棒完成后，就到了測序階段,。
應(yīng)用最先進的HiFi,、HiC和、ONT等三代測序技術(shù),，雖然完成了基因組的初組裝,，但是仍然難以做到全部實現(xiàn)T2T和無缺口的組裝。
2021年底,，隨著李博生加入團隊,，利用自己研發(fā)的選擇性測序方法和超長測序技術(shù)填補了基因組的存在和端粒,，全部基因組均實現(xiàn)了T2T和無缺口的組裝。
繼李博生完成測序工作后,，何航帶領(lǐng)團隊夜以繼日完成最后沖刺,，常常做數(shù)據(jù)分析做到半夜兩三點。
每兩周開一次組會,，討論進展,、分析結(jié)果、分享新的發(fā)現(xiàn),，是接力賽順利完成交接棒的原因,。
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