在過(guò)去四年里,,世界衛(wèi)生組織(WHO)已經(jīng)兩次把猴痘病毒列為全球最高級(jí)別的公共衛(wèi)生緊急事件,然而目前針對(duì)猴痘的治療方法還非常有限,。近日,,南京大學(xué)化學(xué)化工學(xué)院鄭鵬教授課題組在猴痘病毒研究領(lǐng)域取得一項(xiàng)新突破,,團(tuán)隊(duì)利用人工智能(AI)、分子動(dòng)力學(xué)和單分子力譜等先進(jìn)技術(shù),,解析了猴痘病毒如何感染和結(jié)合人體細(xì)胞的機(jī)制,,并成功設(shè)計(jì)了可用于治療猴痘的新型蛋白候選藥物。目前,,該研究成果已在國(guó)際著名生物期刊《elife》上發(fā)表,。
猴痘病毒是一種人畜共患病毒,它和天花病毒是“近親”,。雖然它不像天花那么致命,,但仍然會(huì)導(dǎo)致皮膚潰爛,嚴(yán)重時(shí)可能引發(fā)肺炎或腦炎,。截至目前,,已在100多個(gè)國(guó)家和地區(qū)發(fā)現(xiàn)了猴痘確診病例,找到猴痘的“弱點(diǎn)”,,開發(fā)新藥和疫苗至關(guān)重要,。
據(jù)介紹,課題組突破傳統(tǒng)研究手段的限制,,結(jié)合人工智能(AI)與分子動(dòng)力學(xué)模擬,,首次解析了猴痘病毒感染宿主細(xì)胞的關(guān)鍵分子機(jī)制。研究團(tuán)隊(duì)利用AI技術(shù)分析大量病毒蛋白結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù),,并結(jié)合分子動(dòng)力學(xué)模擬,,精確預(yù)測(cè)了猴痘病毒表面蛋白與宿主受體的結(jié)合模式,。隨后,通過(guò)單分子力譜技術(shù),,研究人員直接測(cè)量了病毒蛋白與宿主細(xì)胞受體的相互作用力,最終成功揭示了病毒的黏附機(jī)制,。團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn),,猴痘病毒利用特定蛋白與宿主細(xì)胞膜上的受體結(jié)合,形成強(qiáng)大的分子相互作用,,從而實(shí)現(xiàn)穩(wěn)固的感染,。這一發(fā)現(xiàn)為阻斷病毒侵染提供了全新策略。
“過(guò)去,,科學(xué)家發(fā)明一種新藥通常要花10到15年,,需要大量的實(shí)驗(yàn),測(cè)試成千上萬(wàn)種分子,,看看哪種可以對(duì)抗病毒或細(xì)菌,。就像大海撈針,既費(fèi)時(shí)間,,又很難成功,。”鄭鵬科普道,,AI可以讓這一過(guò)程變得更快,、更精準(zhǔn),一方面,,AI可以幫助找到病毒的“弱點(diǎn)”,,“
病毒要進(jìn)入人體細(xì)胞,通常需要某些特殊的蛋白質(zhì)來(lái)‘黏附’細(xì)胞,,科學(xué)家用AI分析病毒的結(jié)構(gòu),,就像用顯微鏡觀察病毒的‘武器’,找到它最關(guān)鍵的部分——這個(gè)地方就是藥物可以攻擊的目標(biāo),?!绷硪环矫妫珹I可以“設(shè)計(jì)”適合的藥物,,“AI可以在電腦里模擬成千上萬(wàn)種可能的藥物分子,,快速找到最有可能有效的候選藥物,然后再進(jìn)行實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證,。這樣可以節(jié)省幾年的時(shí)間,。”
據(jù)介紹,,團(tuán)隊(duì)不僅在AI建模,、分子動(dòng)力學(xué)模擬,、單分子力譜測(cè)量等多個(gè)領(lǐng)域進(jìn)行深耕,還整合了生物化學(xué),、計(jì)算生物學(xué)和生物物理學(xué)等跨學(xué)科技術(shù),,推動(dòng)了蛋白藥物研發(fā)的新方向?!?024年諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)授予AI蛋白設(shè)計(jì)技術(shù),,我們對(duì)AI技術(shù)在生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域應(yīng)用的潛力充分看好,也取得了階段性成績(jī),?!编嶚i表示,未來(lái),,隨著AI技術(shù)的進(jìn)一步發(fā)展,,AI設(shè)計(jì)蛋白藥物有望成為抗病毒治療的新范式,徹底改變現(xiàn)有的藥物研發(fā)模式,,“我們希望通過(guò)AI技術(shù),,讓蛋白設(shè)計(jì)進(jìn)入智能化時(shí)代,開發(fā)更多基于AI的新型藥物和疫苗,,加速人類對(duì)抗疾病的步伐,。”