DNA存儲技術概念圖
DNA存儲高效低耗,但作為一種鏈式生物大分子,,在體外常溫保存時會面臨DNA斷裂降解等風險,,嚴重影響信息存儲的長期可靠性,是亟待解決的關鍵科學問題,。對此,,元英進團隊設計了基于德布萊英圖理論的序列重建算法來解決DNA斷裂等問題,。該算法結合貪婪路徑搜索和循環(huán)冗余校驗碼來實現斷裂DNA片段的高效從頭組裝,從原理上支持了DNA存儲的長期可靠性,。
結合該序列重建算法(內碼)與噴泉碼算法(外碼),,團隊設計編碼了6.8MB敦煌壁畫,合成了承載圖片信息的DNA片段21萬條,。為數據的長期可靠性,,團隊制備了一個沒有任何特殊保護的DNA水溶液樣本,并在70℃下加速樣本斷裂,、降解長達十周,。處理后的DNA片段80%以上都發(fā)生了斷裂錯誤,依靠設計的序列重建算法依然可以準確組裝并解碼96.4%以上的片段,,再通過噴泉碼解決少量片段丟失的問題,,原始的敦煌壁畫圖片依然能夠完美恢復。根據理論推算,,這種程度的高溫破壞相當于實驗室常溫25℃一千年或者9.4℃長達兩萬年的自然保存,。
這是繼基于人工合成染色體的酵母體內信息存儲模式取得突破后,天津大學合成生物學團隊在DNA信息體外存儲模式上取得的又一重要突破,。