如果說徐達下令建城是第一次大規(guī)模修筑通州城,，那么從正統(tǒng)十四年(1449年)到景泰元年(1450年),，為應對戰(zhàn)亂而倉促修建的新城則是第二次修筑通州城。

由于明朝正統(tǒng)年間修建的通州新城是在緊急情況下進行的，新城城墻不及舊城一半高,。于是，到了正德六年(1511年),，在巡撫都御史李貢的主持下,，開始了對通州城的第三次修筑,。

通過三次修筑,，通州城規(guī)模更加龐大,。而此后的重修通惠河，更是提高了通州在漕運中的地位,，使通州更加繁華,。

元代郭守敬開鑿的通惠河，到了元末明初,，由于戰(zhàn)亂和自然災害,，日漸荒廢，鑒于此,，巡按直隸監(jiān)察御史吳仲向嘉靖皇帝建議重修通惠河。疏浚工程于嘉靖七年(1528年)二月四日開工,，五月二十二日竣工,，歷時三個多月。重修后的通惠河在通州境內(nèi)沒有沿用元代的河道,，而是利用了金代閘河故道,，至通州城北匯入北運河。自此,，通惠河河口由張家灣移到通州城的東北,。

通州新舊城的合二為一，則是在清代,。乾隆三十年(1765年),，總督方觀承請朝廷重修通州城，拆掉舊城的西墻,，將新城和舊城合二為一,。

在歷史的故紙堆里，看到了一份繪制于清光緒九年(1883年)的通州城池圖,。圖中的通州依水而建,，以北運河、減水河為主的河流圍繞在古城四周,，古城四周建有城墻,，城內(nèi)建筑帶有濃重的漕運風格，眾多的衙門均與漕運有關(guān),。城北有高聳入云的燃燈塔,，正如清代詩人王維珍所描繪的：“云光水色運河秋,，滿徑槐花感舊游，無恙蒲帆新雨后,，一支塔影認通州,。”至此,，明清通州城形制最終被固定下來,。

從通州城的變化可以看出，明清通州城的修建和完善與保護通州糧倉有直接關(guān)系,，也可以說通州因大運河而得名,，通州城也因漕運而興盛。過去,，通州地區(qū)流傳這樣的民謠：“通州城,，好大的船，燃燈寶塔做桅桿,。鐘鼓樓的艙,，玉帶河的纜，鐵錨落在張家灣”,。