穿山甲 SARS 樣 CoV SRR10168377 與蝙蝠 SARS 樣 CoV RaTG13 僅具有 85% 的同一性,。這表明如果只關注刺突 RBD,穿山甲 SARS 樣 CoV SRR10168377 有可能越過宿主屏障感染人類,。
類似 SARS-CoV 與人 ACE2 的結合,,受體上的 31、41,、82,、353、355 和 357 位殘基在與 SARS CoV-2 刺突蛋白相互作用時會定位到表面,。
從具有ACE2受體41和353位的RBD域中的Asn501來看,,龜類和穿山甲似乎比蝙蝠更接近人類。這表明龜類和穿山甲可能是SARS-CoV-2的潛在擴展宿主,。
了解結構結合機制將有助于找到準確的病毒庫,,并有助于制定預防對策。通過冷凍電子顯微鏡緊急分析 SARS-CoV-2 刺突蛋白的結晶體,,有助于驗證 SARS CoV-2 刺突 RBD 與人類 ACE2 或其他宿主受體之間相互作用的結合點,。
據(jù)報道,SARS-CoV-2刺突蛋白與ACE2的結合能力比SARS-CoV強得多,。這表明SARS-CoV-2的中間宿主更多,。
目前已知龜類作為病毒庫,攜帶數(shù)十種病毒,,包括虹蛙病毒(RV),、尼多病毒(NV),、乳頭瘤病毒(PV)、甲魚虹彩病毒(STIV),、甲魚系統(tǒng)性敗血癥球狀病毒(STSSSV),、龜細小核糖核酸病毒(ToPV)和中華鱉出血綜合征病毒(TSHSV)。不能排除蝙蝠 SARS 樣 CoV RaTG13 或其他 SARS 樣 CoV 感染龜類,,并在進化后向人傳播,。
從SARS-CoV和MERS-CoV到SARS-CoV-2,蝙蝠均是冠狀病毒的天然宿主,,但中間宿主卻各不相同,。此前研究表明,與其他動物相比,,蛇因其同義密碼子相對使用度(RSCU)偏向,,很有可能是SARS-CoV-2的野生動物病毒庫。
果子貍和單峰駱駝作為人畜共患病SARS-CoV和MERS-CoV的中間宿主,,生活在不同的時空環(huán)境,,但它們仍將冠狀病毒傳播給人類。這使得短期內找到SARS-CoV-2的中間宿主很難,。
病毒受體結合序列和宿主受體的分析有助于快速靶向SARS-CoV-2可能的中間宿主,。與非法交易的穿山甲相比,市場上的龜類更普遍受歡迎,。
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