中國(guó)完整破譯小麥“生命天書”
◆給“糧倉(cāng)支柱”裝上基因?qū)Ш健魹樾缕贩N培育按下加速鍵
如果把小麥的基因組比作一本由145億個(gè)字符寫成的“生命天書”,過(guò)去的科學(xué)家只能看到并讀懂其中零散的章節(jié),,而如今,,這本“天書”第一次被從頭到尾完整破譯。
4月7日,,來(lái)自濰坊現(xiàn)代農(nóng)業(yè)山東省實(shí)驗(yàn)室(北京大學(xué)現(xiàn)代農(nóng)業(yè)研究院)的科研團(tuán)隊(duì)在國(guó)際頂級(jí)學(xué)術(shù)期刊《自然·遺傳學(xué)》發(fā)布全球首個(gè)六倍體小麥端粒到端粒(T2T)完整基因組圖譜,,完成對(duì)小麥全部21對(duì)染色體頭尾無(wú)缺口精準(zhǔn)拼接,標(biāo)志著人類對(duì)小麥這一“糧倉(cāng)支柱”的認(rèn)知邁入無(wú)盲區(qū)時(shí)代,。這項(xiàng)被比喻為“給小麥裝上基因?qū)Ш健钡耐黄?,將為高產(chǎn)、抗病,、耐旱,、耐鹽的新品種培育按下加速鍵。
登頂“植物界珠峰”
作為最古老的糧食作物之一,小麥的基因組堪稱“植物界的珠穆朗瑪峰”,,它的遺傳密碼總長(zhǎng)達(dá)14.51Gb,,含145億個(gè)堿基,是水稻的40倍,、人類的5倍,,更擁有三套既高度同源又有明顯分化的亞基因組,如同三套被撕碎后混成一堆的百科全書,。尤其讓科學(xué)家頭疼的是,,基因組中近85%是重復(fù)序列,就像把同一段文字復(fù)印了成千上萬(wàn)次后胡亂拼貼,,傳統(tǒng)測(cè)序技術(shù)如同拿著模糊的放大鏡,,始終無(wú)法看清全貌。
“過(guò)去我們只能通過(guò)零碎的基因組片段推測(cè)小麥的生命邏輯,,現(xiàn)在終于有了完整清晰的圖譜,。”濰坊現(xiàn)代農(nóng)業(yè)山東省實(shí)驗(yàn)室(北京大學(xué)現(xiàn)代農(nóng)業(yè)研究院)主任鄧興旺說(shuō),。
為了把這本小麥“生命天書”拼接完整,,鄧興旺組建了一支21人的跨學(xué)科團(tuán)隊(duì),集合了測(cè)序技術(shù)專家,、生物信息學(xué)家和育種專家,,歷經(jīng)兩年多艱苦攻關(guān),終于在2023年8月繪制出完整圖譜,,實(shí)現(xiàn)“珠峰登頂”,。
基因組測(cè)序是解析生命密碼的關(guān)鍵技術(shù)。在繪制圖譜過(guò)程中,,科研團(tuán)隊(duì)創(chuàng)造性地融合兩種前沿測(cè)序技術(shù):PacBio HiFi測(cè)序技術(shù)如同超高精度顯微鏡,,能夠精準(zhǔn)讀取2萬(wàn)個(gè)堿基長(zhǎng)度的DNA片段;ONT超長(zhǎng)測(cè)序技術(shù)則如同全景廣角相機(jī),,單次測(cè)序長(zhǎng)度可突破20萬(wàn)個(gè)堿基,。為突破數(shù)據(jù)運(yùn)算瓶頸,山東省政府專項(xiàng)支持?jǐn)U容升級(jí)超級(jí)計(jì)算機(jī)中心,,為基因組組裝提供了強(qiáng)大的算力保障,。
為小麥編寫“免疫程序”
濰坊現(xiàn)代農(nóng)業(yè)山東省實(shí)驗(yàn)室(北京大學(xué)現(xiàn)代農(nóng)業(yè)研究院)研究員陳時(shí)盛長(zhǎng)期致力于小麥抗病遺傳育種實(shí)驗(yàn),借助全新基因組圖譜,,他的團(tuán)隊(duì)剛完成一個(gè)抗病基因的定位克隆,?!霸谝郧鞍姹镜膮⒖蓟蚪M圖中,,有些基因所在的染色體區(qū)域存在組裝錯(cuò)誤,一度使課題研究迷失方向、陷入僵局,?!标悤r(shí)盛形象地比喻,“這份圖譜為小麥遺傳研究裝上了完整版的導(dǎo)航系統(tǒng),,我們可以精準(zhǔn)定位基因在染色體上的坐標(biāo),,快速鎖定候選基因,顯著縮短研究周期,?!?/p>
最復(fù)雜的難題往往藏著最珍貴的寶藏?!坝辛送暾驁D譜,,我們第一次能精準(zhǔn)定位控制抗病、高產(chǎn)等性狀的‘開(kāi)關(guān)’,?!闭撐墓餐髡吆魏窖芯繂T展示了3.4萬(wàn)個(gè)過(guò)去未被發(fā)現(xiàn)的高置信度基因。例如,,一批NLR抗病基因的識(shí)別,,讓科學(xué)家能像編寫“免疫程序”般設(shè)計(jì)抗病的小麥。
這項(xiàng)研究成果還帶來(lái)了一系列顛覆性的科學(xué)發(fā)現(xiàn):小麥從四倍體升級(jí)為六倍體時(shí),,基因組發(fā)生過(guò)23次“乾坤大挪移”,,總計(jì)5.18億堿基的染色體倒位,暗示著小麥祖先在進(jìn)化中不斷“試錯(cuò)重組”,,最終篩選出最優(yōu)版本,;占基因組大頭的重復(fù)序列也并非“垃圾文件”,其中隱藏著小麥進(jìn)化的“生存智慧”,,海量的遺傳變異素材使其能夠在氣候變化和病蟲(chóng)害威脅中“見(jiàn)招拆招”,。
給種子裝上“中國(guó)芯”
作為全球最重要的糧食作物,小麥年產(chǎn)量已接近8億噸,,養(yǎng)活了全球35%以上的人口,。隨著中國(guó)科研團(tuán)隊(duì)將完整基因組數(shù)據(jù)向全球開(kāi)放共享,人類在馴化小麥一萬(wàn)年后,,終于真正讀懂了這位“老朋友”的生命密碼,。
這項(xiàng)成果也被視為應(yīng)對(duì)糧食危機(jī)的“科技盾牌”。隨著全球氣候變化加劇,,極端干旱,、高溫和新型病原體頻發(fā),小麥主產(chǎn)區(qū)的穩(wěn)產(chǎn)壓力陡增,?!巴暾蚪M就像一套‘應(yīng)急預(yù)案庫(kù)’,,我們可以快速找到讓小麥耐旱、耐鹽的基因組合,,設(shè)計(jì)出適應(yīng)更惡劣環(huán)境的‘未來(lái)小麥’,。”鄧興旺告訴記者,,通過(guò)掌握雜交小麥技術(shù)制高點(diǎn),,團(tuán)隊(duì)正在培育兼具抗病、高產(chǎn),、優(yōu)質(zhì)特性的突破性新品種,,目前已開(kāi)發(fā)出20余項(xiàng)核心專利技術(shù)。
正如鄧興旺所言:“讀懂小麥的基因組,,就握緊了糧食安全的命脈,。”這場(chǎng)已持續(xù)數(shù)十年的“基因解碼戰(zhàn)”,,不僅讓中國(guó)在國(guó)際農(nóng)業(yè)科技競(jìng)爭(zhēng)中搶占先機(jī),,更讓“中國(guó)飯碗”裝“中國(guó)糧”的底氣更足。
(大眾新聞?dòng)浾咄跫崖晱堓恚?/p>