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新冠肺炎核酸檢測假陰性率為何這么高

新冠肺炎核酸檢測假陰性率為何這么高
2020-02-26 12:33:01 科技日報

新冠肺炎疫情發(fā)生以來,,關(guān)于核酸檢測假陰性率過高的話題,一直是各方關(guān)注的焦點。有報道稱,以熒光定量RT-PCR作為檢測手段的新冠病毒檢測的陽性率目前僅有30%—50%,,導(dǎo)致奇高的假陰性率。

導(dǎo)致假陰性率發(fā)生的原因很多,。2月22日,,南京大學(xué)模式動物研究所發(fā)育生物學(xué)與遺傳學(xué)教授趙慶順接受科技日報記者獨家采訪時指出,依據(jù)有關(guān)機(jī)構(gòu)發(fā)布的指南,,核酸檢測前需將采集到的樣品進(jìn)行56℃滅活,這極有可能使新冠病毒核酸被降解,,從而導(dǎo)致不能被正常檢出,,最終提高了假陰性率。該研究成果《病毒核酸提取前的高溫滅活過程顯著降低可檢出病毒核酸模板量》,,已在中國科學(xué)院科技論文平臺預(yù)發(fā)布,。

56℃滅活可能導(dǎo)致病毒核酸被降解

2019新型冠狀病毒的遺傳物質(zhì)是單鏈RNA。因此,,科研人員的目標(biāo)是在患者身上找到新冠病毒的RNA,。這也是臨床診斷金標(biāo)準(zhǔn)。

目前,,臨床檢測主要采用熒光定量RT-PCR試劑盒檢測,。該方法是將標(biāo)本中的特定RNA序列逆轉(zhuǎn)錄后進(jìn)行擴(kuò)增,,經(jīng)過30次以上擴(kuò)增后,病毒基因片段達(dá)到一定數(shù)量即可進(jìn)行可視檢測,。

“理論上,,哪怕模板只有1個病毒,就有可能被檢測出來,?!壁w慶順說,科研實踐中,,在模板(病毒)量大于100個的情況下,,擴(kuò)增結(jié)果就會非常穩(wěn)定。

但是,,趙慶順在網(wǎng)絡(luò)上看到一個教學(xué)視頻,,不禁心生疑慮。該視頻由北京協(xié)和醫(yī)院和北京市衛(wèi)健委聯(lián)合制作,。視頻3分08秒至3分40秒顯示:在制備核酸模板前,,需將采集到的樣品在56℃條件下進(jìn)行30分鐘病毒滅活。

記者在中華醫(yī)學(xué)會檢驗醫(yī)學(xué)分會發(fā)布的《2019新型冠狀病毒肺炎臨床實驗室檢測的生物安全防護(hù)指南(試行第一版)》中也看到:核酸擴(kuò)增前,,可以對標(biāo)本先行消毒,。包括56℃孵育30分鐘,加蛋白酶K,。

中華醫(yī)學(xué)會檢驗醫(yī)學(xué)分會發(fā)布的《新型冠狀病毒肺炎病毒核酸檢測專家共識》中,,明確指出需將樣品56℃孵育至少45分鐘或更高溫度進(jìn)行滅活。

記者通過采訪確認(rèn),,絕大多數(shù)檢驗醫(yī)師均按照上述規(guī)范,,進(jìn)行56℃條件下時間不等的病毒滅活,然后才制備核酸模板,。

這樣做帶來的問題是,,病毒RNA極易被核糖核酸酶降解,因為這種酶在60℃時活性最高,。核糖核酸酶來自兩方面,,一是樣本細(xì)胞內(nèi),二是采集,、保存,、運輸過程中的外來污染物。

進(jìn)行滅活處理是出于生物安全的考慮

“進(jìn)行滅活處理是出于生物安全的考慮,,保護(hù)從事檢測的工作人員不被病毒感染,。”趙慶順說,。

正是出于這方面的考慮,,國家衛(wèi)健委發(fā)布的相關(guān)文件中,,明確要求對標(biāo)本進(jìn)行滅活處理。

北京協(xié)和醫(yī)院制作的教學(xué)視頻以及中華醫(yī)學(xué)會檢驗醫(yī)學(xué)分會發(fā)布的《防護(hù)指南》和《專家共識》,,依據(jù)正是來自國家衛(wèi)健委相關(guān)文件,,包括《新型冠狀病毒實驗室生物安全指南(第二版)》《新型冠狀病毒肺炎實驗室檢測技術(shù)指南(第三版)》等。

但是,,記者查詢了國家衛(wèi)健委相關(guān)文件,,其對于病毒滅活的具體方法并未做出明確規(guī)定,只是籠統(tǒng)地要求:感染性材料或活病毒在采用可靠的方法滅活后進(jìn)行的核酸檢測,。

趙慶順進(jìn)一步查閱了美國疾控中心,、香港大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院以及華大基因發(fā)布的核酸檢測說明,也未發(fā)現(xiàn)56℃滅活這一步驟,。

病毒核酸降解對檢測結(jié)果影響究竟有多大

記者在采訪中發(fā)現(xiàn),,不同人士對這個問題的回答涇渭分明:

來自疾控部門、中國醫(yī)學(xué)會檢驗醫(yī)學(xué)分會,、相關(guān)醫(yī)院檢驗醫(yī)師的看法是,,不會對檢測結(jié)果有太大的影響。而趙慶順等專家認(rèn)為,,核酸提取前對人體樣品進(jìn)行高溫殺毒處理,,可能是導(dǎo)致新冠病毒核酸檢出假陰性率過高的重要原因之一。

趙慶順以豬流行性腹瀉病毒(一種冠狀病毒,,來自活疫苗)為模型開展了高溫滅活對病毒可檢出量影響的研究,,結(jié)果表明:保存在普通等滲溶液(Hank’s液)中的樣品經(jīng)56℃孵育30分鐘,導(dǎo)致樣品中可檢出的冠狀病毒模板減少一半,,如果以92℃孵育5分鐘,,則可檢出的冠狀病毒模板損失96%以上。

“理論上,,不排除新冠病毒的目標(biāo)RNA片段在56℃以上高溫滅活中不易被降解的可能,。”趙慶順坦言,,“但我寧愿自己的判斷是錯的,,也不希望因為某個細(xì)節(jié)考慮不周而導(dǎo)致檢測結(jié)果出現(xiàn)假陰性?!?/p>

另外,不同品牌的樣品保存液,,也會對檢測結(jié)果產(chǎn)生較大影響,。趙慶順在實驗中發(fā)現(xiàn),在56℃30分鐘條件下,,采用南京諾唯贊研發(fā)的R503保存液存放豬流行性腹瀉病毒樣品時,,病毒核酸的可檢出量是對照組(Hank’s液)檢出量的3倍,;而如果是92℃5分鐘滅活,則檢出量是對照組的42倍,。

中華醫(yī)學(xué)會檢驗醫(yī)學(xué)分會主任委員王成彬教授在撰文回應(yīng)核酸檢測假陰性率較高現(xiàn)象時也指出,,不同提取試劑對最后提取到的核酸數(shù)量和質(zhì)量可能存在差別,從而直接影響檢測結(jié)果,。他建議,,對于某些高度疑似病例,或檢測結(jié)果難以確定的病例,,建議用2種以上試劑進(jìn)行檢測,、驗證。

“假陰性意味著漏檢,,不僅會導(dǎo)致臨床中對疑似患者不能快速確診,,而且會使漏檢者成為潛在的病毒傳染源?!壁w慶順為此提出建議,,一是盡量使用無核糖核酸酶污染的樣本采集管,二是將標(biāo)本放置在可保護(hù)病毒核酸免受高溫滅活損壞的樣品保存液中,,從而確保樣品RNA從保存,、運輸?shù)礁邷販缁畹鹊玫饺瘫Wo(hù),盡最大可能保證用于臨床檢測的核酸質(zhì)量,,減少病毒核酸可檢出模板在核酸提取前的人為損壞,。

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