但在上世紀90年代,，庫區(qū)的濕地生態(tài)也曾遭遇巨大的人為破壞,。南部沿岸一些農(nóng)民進入保護區(qū)內(nèi)開荒種田,，他們修堤筑壩、抽干湖水,、砍伐樹林,，3萬畝林木遭毀，亂墾農(nóng)田約5萬畝,。自然植被損巨大,，生態(tài)環(huán)境惡化，野生鳥類種類劇減,，僅剩下10余種,。

據(jù)介紹，2003年青銅峽庫區(qū)濕地自然保護區(qū)管理局成立后,，經(jīng)過艱難綜合治理,，情況逐漸好轉(zhuǎn)。庫區(qū)成為寧夏濕地自然保護區(qū),，鳥島獲批國家濕地公園,。2017年以來，持續(xù)對包括保護區(qū)內(nèi)的人類活動點位進行全面清理整治,，中央和地方資金投入近億元,，實施退耕還濕,，涉及退耕的12萬多畝濕地全部收回，地面建筑全部清理,，生產(chǎn)經(jīng)營活動全部退出,。保護區(qū)西緣還修建了圍欄和防火隔離帶，打通了水系,，阻隔了人類活動的干擾,。修建了巡護道路，增加巡查人員加大巡查頻次,，安裝視頻監(jiān)控系統(tǒng),，保護區(qū)內(nèi)違法活動得到有效遏制。

目前,，自然保護區(qū)總面積有197平方公里近30萬畝,，南北長超過40公里，東西最寬處7.7公里,，最窄處2.5公里,。保護區(qū)山水林田湖草已然融為一體，生物多樣性豐富多彩,。這里的環(huán)境將會持續(xù)優(yōu)化,，鳥類和水生植物更加豐富，全面恢復(fù)的生態(tài)還濕地以寧靜,、和諧,、美麗，將更好地造福寧夏,、惠及黃河,。