冠狀病毒(CoVs)是一類RNA病毒,,能夠引發(fā)人類和動物的呼吸道及腸道疾病,。這類病毒大多起源于蝙蝠,并且歷史上多次從蝙蝠傳播至其他物種,引發(fā)了全球關注的公共衛(wèi)生事件,。2002年的SARS,、2016年的豬急性腹瀉綜合癥(SADS),,以及2019年底爆發(fā)的新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)疫情,,都突顯了蝙蝠來源冠狀病毒對全球健康構(gòu)成的重大威脅。近日,,一項由中國科學院武漢病毒研究所石正麗團隊發(fā)表于《Nature Communications》的研究,,深入探討了中國蝙蝠冠狀病毒的進化、跨物種傳播及其地理分布特征,。
蝙蝠被認為是SARS冠狀病毒,、中東呼吸綜合癥(MERS)冠狀病毒,以及常見的人類冠狀病毒NL63和229E的祖先來源,。尤其是翅蝠屬(Rhinolophus)蝙蝠,,被確認為SARS-CoV和SADS-CoV的天然宿主。中國是世界上蝙蝠多樣性最豐富的地區(qū)之一,,擁有超過100種蝙蝠,,其中許多為特有種。然而,,關于這些蝙蝠體內(nèi)冠狀病毒的具體進化路徑和傳播機制,,科學家們?nèi)匀恢跎佟?/p>
該研究利用貝葉斯統(tǒng)計框架,結(jié)合來自中國各地蝙蝠的589條冠狀病毒序列數(shù)據(jù),,進行了廣泛的分析,。研究結(jié)果揭示了α型和β型冠狀病毒在不同蝙蝠科和屬之間的進化關系及其跨物種傳播模式:
宿主交換頻率:α型冠狀病毒表現(xiàn)出較高的宿主交換頻率,且跨越的宿主類群較為遙遠,;相比之下,,β型冠狀病毒的宿主交換則更多地受限于系統(tǒng)發(fā)育距離。
熱點宿主類群:菊頭蝠科(Rhinolophidae)及菊頭蝠屬(Rhinolophus)中的跨科和跨屬宿主交換最為頻繁,,成為重要的病毒傳播橋梁,。
地理分布特征:研究表明,西南地區(qū)是中國冠狀病毒進化的熱點區(qū)域,,尤其對于α型冠狀病毒而言,。該地區(qū)的高生物多樣性和復雜的生態(tài)系統(tǒng)可能促進了病毒的多樣化發(fā)展。
通過系統(tǒng)發(fā)育分析,,研究人員提出了SARS-CoV-2可能起源于菊頭蝠屬蝙蝠的新證據(jù),。這一結(jié)論進一步支持了先前關于SARS-CoV-2與蝙蝠相關性的假設,強調(diào)了加強蝙蝠源性冠狀病毒監(jiān)測的重要性,。
使用貝葉斯離散種群地理學模型重建的時空擴散圖顯示,,α型冠狀病毒主要從中國西南和南方區(qū)域向外擴散,而β型冠狀病毒同樣起源于這兩個區(qū)域,,并多次擴散到其他地方,。南方區(qū)域在兩種類型冠狀病毒的遷移過程中扮演了核心角色。
通過對平均系統(tǒng)發(fā)育距離(MPD),、最近物種距離(MNTD)及其標準化效應值(SES)的計算,,研究發(fā)現(xiàn)了中國冠狀病毒的系統(tǒng)發(fā)育多樣性熱點。特別是西南地區(qū)的α型冠狀病毒顯示出較高的進化多樣性,,表明該區(qū)域可能是未來冠狀病毒監(jiān)測的重點,。
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本研究不僅加深了我們對蝙蝠冠狀病毒進化和傳播機制的理解,還指出了中國南部和西南部作為潛在的冠狀病毒多樣性中心的重要性,。鑒于這些地區(qū)具有亞熱帶氣候,、人口密集和快速城市化的特點,它們可能成為新型冠狀病毒出現(xiàn)的溫床,。因此,,未來的采樣工作應集中于這些區(qū)域,并擴展至鄰近國家如緬甸、老撾和越南,,以加強對新型冠狀病毒的早期預警能力,。
此外,考慮到α型冠狀病毒在宿主轉(zhuǎn)換中的高潛力及其較強的跨物種傳播能力,,研究建議加大對α型冠狀病毒的監(jiān)測力度,,特別是針對馬蹄蝙蝠、扇蝙蝠,、大夜蝙蝠和小翼蝙蝠等蝙蝠屬的持續(xù)跟蹤,,以評估其對人類或家畜健康的潛在風險。
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