然而危機(jī)并未因大屠殺的沉寂而就此告一段落,。原本在剛果(金)東部的南北基伍省等地,,親金沙薩(剛果(金)首都)當(dāng)局的“瓦扎倫多斯”各部族與胡圖族,、圖西族等大湖區(qū)民族的“巴尼亞穆格尼倫”各部族間沖突不斷,,前者倚仗當(dāng)時(shí)強(qiáng)勢(shì)的蒙博托(剛果(金)前總統(tǒng))政府壓制后者,,雙方仇怨甚深,。
盧旺達(dá)慘劇導(dǎo)致200萬(wàn)以上胡圖族,、圖西族難民流入該地,,很大程度上改變了當(dāng)?shù)孛褡褰Y(jié)構(gòu),,部分前盧旺達(dá)政府軍(大屠殺肇事者)成立“盧旺達(dá)解放民主力量”,以這里為據(jù)點(diǎn)不斷發(fā)動(dòng)對(duì)盧旺達(dá)卡加梅(盧旺達(dá)總統(tǒng))政權(quán)的騷擾,,而得到部分“巴尼亞穆格尼倫”部族支持的盧旺達(dá)軍隊(duì)則以“打擊大屠殺罪犯”為由介入邊境另一側(cè)的沖突,。
1997年,曾與卡加梅結(jié)盟的老卡比拉(推翻蒙博托政權(quán)后,,成為剛果(金)總統(tǒng))偕同盧旺達(dá),、烏干達(dá)兩國(guó)軍隊(duì)發(fā)起對(duì)剛果(金)蒙博托政權(quán)的總攻并奪取政權(quán),這在客觀上強(qiáng)化了盧旺達(dá)在剛果(金)東部的政治,、軍事影響力,。
1998年,老卡比拉和盧旺達(dá)關(guān)系破裂,,開(kāi)始動(dòng)用武力驅(qū)逐盧旺達(dá)軍隊(duì),,并借機(jī)壓制南北基伍省的部族和反對(duì)派勢(shì)力,爆發(fā)了所謂“第二次基伍戰(zhàn)爭(zhēng)”(1994年為第一次),。盡管剛果(金)和盧旺達(dá)2002年達(dá)成?;饏f(xié)議并實(shí)現(xiàn)關(guān)系正常化,,但地區(qū)沖突的根源早已深埋,。
2006年,“巴尼亞穆格尼倫”部族領(lǐng)袖,、前剛果(金)政府軍軍官恩孔達(dá)宣布成立反政府武裝“全國(guó)保衛(wèi)人民大會(huì)”(CNDP),,剛果(金)指責(zé)盧旺達(dá)為“幕后黑手”,而后者堅(jiān)決否認(rèn),。
在國(guó)際社會(huì)斡旋下,,兩國(guó)在2009年發(fā)動(dòng)聯(lián)合邊界行動(dòng),逮捕了恩孔達(dá),,并推動(dòng)金沙薩政府和CNDP簽署和平協(xié)議,,由時(shí)任剛果(金)總統(tǒng)約瑟夫·卡比拉和盧旺達(dá)總統(tǒng)卡加梅共同擔(dān)保,CNDP在放棄武裝前提下作為政黨參與剛果(金)政治活動(dòng),,其武裝整合為剛果(金)政府軍和警察的一部分,。2009年約瑟夫·卡比拉和卡加梅在戈馬舉行歷史性會(huì)晤,人們一度認(rèn)為“問(wèn)題業(yè)已解決”。