到了13世紀(jì),,德里蘇丹帝國時(shí)期,,伊斯蘭教在印度如雨后春筍般出現(xiàn),蘇菲派傳教士在此時(shí)進(jìn)入克什米爾,,伊斯蘭教逐漸傳播,。隨著1339年,統(tǒng)治克什米爾地方的沙赫米爾王朝(Shah Mir Dynasty)建立,,克什米爾開始進(jìn)入穆斯林統(tǒng)治時(shí)期,,正是從此時(shí)開始,穆斯林逐漸成為了克什米爾地區(qū)的主要居民,。
1526年,,來自今天烏茲別克斯坦的突厥部落酋長巴布爾進(jìn)入北印度,,建立了印度歷史上疆域最為廣袤的莫臥兒帝國(鼎盛時(shí)期,,領(lǐng)土包括今天的印度、孟加拉國以及阿富汗大部),。在阿克巴大帝統(tǒng)治期間,,克什米爾被納入莫臥爾帝國的疆域,,但地方總督仍然有著較大的自主權(quán)。
隨著帝國連年征戰(zhàn),,財(cái)政入不敷出,,加上英國殖民者開始進(jìn)入印度,18世紀(jì)以后,,莫臥兒帝國名存實(shí)亡,,克什米爾的分離主義再次興起??耸裁谞柕目偠较仁窍蚪y(tǒng)治阿富汗的艾哈邁德·沙阿·杜蘭尼國王求救,,后者出兵將克什米爾納入自己統(tǒng)治麾下。與此同時(shí),,旁遮普地區(qū)的錫克人勢力也開始逐漸壯大,,在19世紀(jì)初期,錫克人趕走了克什米爾地區(qū)阿富汗國王,,將克什米爾納入錫克帝國的統(tǒng)治范疇,。值得一提的是,錫克帝國于19世紀(jì)30年代向處于西藏控制之下的拉達(dá)克地區(qū)進(jìn)軍,,彼時(shí)的清朝駐藏大臣拒絕發(fā)兵援助,,拉達(dá)克地區(qū)就此落入克什米爾統(tǒng)治者的勢力范圍之內(nèi),錫克帝國的擴(kuò)張野心,,為后來印度與中巴兩國的邊境沖突,,埋下了一顆暗雷。
就在此時(shí),,英帝國在印度的殖民影響力日漸深遠(yuǎn),,印度在英帝國諸多殖民地中,號(hào)稱“英王王冠上最閃亮的明珠”,,可見英國對印度的重視程度,。在殖民印度之際,英國采取了直接統(tǒng)治與分而治之相結(jié)合的方式,,前者即直接將印度視作國王的私產(chǎn),,并且派出總督直接管理,后者是在印度拉攏一些王公貴族,,建立土邦,,直接聽命于英國的統(tǒng)治。而錫克帝國作為一個(gè)獨(dú)立的地方強(qiáng)國,,與英國的殖民利益背道而馳,。恰好錫克帝國此時(shí)陷入激烈的內(nèi)斗之中,一位名叫古拉伯·辛格(他是一名印度教徒,錫克帝國采用的是宗教寬容政策,,并不是印象中的錫克教與印度教極端對立,,水火不容)的地方官員,渴望借助英國人的力量,,加強(qiáng)自己對所在地區(qū)的控制力,。就這樣,英國的東印度公司與古拉伯·辛格里應(yīng)外合,,擊敗了錫克帝國,,錫克帝國只得承認(rèn)克什米爾地區(qū)的獨(dú)立地位。英國人扶持古拉伯·辛格成為克什米爾的大君,,確立了查謨和克什米爾土邦的主權(quán)地位,。統(tǒng)治克什米爾的大君是印度教徒,但穆斯林人口在這一區(qū)域的占比近八成,,大君也習(xí)慣于盤剝底層穆斯林,,在這樣的情形之下,克什米爾地區(qū)的宗教與階級(jí)矛盾愈演愈烈,。