克拉瑪依市艾里克湖是自治區(qū)2015年批準(zhǔn)的生態(tài)環(huán)境保護(hù)試點(diǎn)湖泊,，但列入試點(diǎn)的治理工程進(jìn)度滯后,，底泥疏浚,、圍欄禁牧等9個(gè)項(xiàng)目至今尚未下達(dá)資金，嚴(yán)重影響水質(zhì)改善,。在入湖水量增加近1倍的情況下,，湖泊水質(zhì)仍由2014年Ⅴ類下降為2016年劣Ⅴ類。巴州博斯騰湖列入國(guó)家良好湖泊生態(tài)保護(hù)試點(diǎn),，但相關(guān)治理項(xiàng)目進(jìn)展緩慢,，博湖縣、大河口景區(qū)等污水處理廠或超標(biāo)排放或不正常運(yùn)行,，湖泊水質(zhì)沒有達(dá)到預(yù)期治理目標(biāo),。烏魯木齊市柴窩堡湖周邊長(zhǎng)期超采地下水，嚴(yán)重影響湖泊補(bǔ)水,，導(dǎo)致湖面面積大幅度縮小,。

2017年8月31日,，中央第八環(huán)境保護(hù)督察組現(xiàn)場(chǎng)檢查發(fā)現(xiàn),，烏魯木齊市部分污水處理廠非法傾倒污泥侵占破壞國(guó)家級(jí)公益林。圖為工作人員對(duì)污泥進(jìn)行現(xiàn)場(chǎng)取樣,。環(huán)保部供圖

三是有的地方存在損害生態(tài)環(huán)境問題,。2013年以來(lái)，博州國(guó)投公司參股博艾豐生物制品公司違規(guī)在艾比湖國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)核心區(qū)開挖溝渠,，捕撈鹵蟲,，并取得分紅,；博州水利局違規(guī)為博艾豐生物制品公司發(fā)放捕撈許可證，收取漁業(yè)資源增值保護(hù)費(fèi),。礦山環(huán)境恢復(fù)治理滯后,，全區(qū)已閉坑的礦山和政策性關(guān)閉的小煤礦、砂石粘土礦等礦山破壞面積達(dá)到2165平方公里,，截至目前僅完成治理面積3.77%,。吐魯番市艾維爾溝、昌吉州硫磺溝等地濫采濫挖問題突出,，生態(tài)恢復(fù)嚴(yán)重滯后,。

另外，新疆水資源極其短缺,，但對(duì)國(guó)家地下水禁采,、限采要求落實(shí)不力。烏魯木齊市米東區(qū)2016年2月被劃定為地下水嚴(yán)重超采區(qū),，但截至2017年7月,，米東區(qū)仍有91家工業(yè)企業(yè)的149眼自備水井開采地下水，大量抽取地下水導(dǎo)致該區(qū)域地下水位出現(xiàn)下降,。巴州庫(kù)爾勒市建成區(qū)2014年9月被劃定為地下水禁采區(qū)后,，到目前為止，禁采規(guī)定仍沒有落到實(shí)處,，2016年地下水水位較2013年最大下降2.18米,，對(duì)全市生態(tài)環(huán)境構(gòu)成較大威脅。